Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APBA1Q02410 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA1Q02410 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms