Protein–RNA interactions for Protein: P99999

CYCS, Cytochrome c, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP99999 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYCSP99999 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYCSP99999 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYCSP99999 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYCSP99999 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYCSP99999 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYCSP99999 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYCSP99999 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CYCSP99999 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYCSP99999 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYCSP99999 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYCSP99999 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYCSP99999 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYCSP99999 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYCSP99999 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYCSP99999 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYCSP99999 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYCSP99999 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYCSP99999 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYCSP99999 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYCSP99999 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYCSP99999 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYCSP99999 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CYCSP99999 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYCSP99999 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYCSP99999 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYCSP99999 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYCSP99999 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYCSP99999 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYCSP99999 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CYCSP99999 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYCSP99999 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYCSP99999 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYCSP99999 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYCSP99999 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYCSP99999 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYCSP99999 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYCSP99999 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYCSP99999 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYCSP99999 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYCSP99999 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYCSP99999 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYCSP99999 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYCSP99999 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYCSP99999 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYCSP99999 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYCSP99999 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYCSP99999 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYCSP99999 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYCSP99999 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYCSP99999 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYCSP99999 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYCSP99999 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYCSP99999 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYCSP99999 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYCSP99999 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYCSP99999 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYCSP99999 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYCSP99999 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYCSP99999 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYCSP99999 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYCSP99999 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYCSP99999 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYCSP99999 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYCSP99999 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYCSP99999 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYCSP99999 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYCSP99999 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYCSP99999 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYCSP99999 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYCSP99999 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYCSP99999 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYCSP99999 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYCSP99999 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYCSP99999 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYCSP99999 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYCSP99999 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYCSP99999 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYCSP99999 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYCSP99999 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYCSP99999 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYCSP99999 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYCSP99999 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYCSP99999 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYCSP99999 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYCSP99999 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYCSP99999 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYCSP99999 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYCSP99999 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYCSP99999 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYCSP99999 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYCSP99999 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYCSP99999 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYCSP99999 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYCSP99999 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYCSP99999 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYCSP99999 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYCSP99999 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYCSP99999 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYCSP99999 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms