Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
EFNB1P98172 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNB1P98172 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms