Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERV-K104P61576 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
HERV-K104P61576 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERV-K104P61576 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERV-K104P61576 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERV-K104P61576 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERV-K104P61576 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERV-K104P61576 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERV-K104P61576 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERV-K104P61576 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms