Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSE1LP55060 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSE1LP55060 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms