Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 PDHA1-204ENST00000379806 3484 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.979e-9■■■■■ 34.3
SUB1P53999 PDHA1-202ENST00000379804 709 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.429e-9■■■■■ 34.3
SUB1P53999 NNT-202ENST00000344920 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.796e-7■■■■■ 34.2
SUB1P53999 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.361e-13■■■■■ 34.2
SUB1P53999 PSMB4-202ENST00000466425 665 ntTSL 25.37□□□□□ -1.556e-7■■■■■ 34.2
SUB1P53999 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.415e-7■■■■■ 34.2
SUB1P53999 CREG1-202ENST00000466652 794 ntTSL 36.8□□□□□ -1.325e-7■■■■■ 34.2
SUB1P53999 TSN-208ENST00000490104 2717 ntTSL 210.94□□□□□ -0.663e-8■■■■■ 34.1
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SUB1P53999 PABPC4-206ENST00000437136 876 ntTSL 58.46□□□□□ -1.066e-7■■■■■ 34.1
SUB1P53999 PABPC4-209ENST00000468476 3592 ntTSL 27.13□□□□□ -1.276e-7■■■■■ 34.1
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SUB1P53999 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.839e-7■■■■■ 34
SUB1P53999 RPL34-207ENST00000506397 549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.973e-18■■■■■ 34
SUB1P53999 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.743e-18■■■■■ 34
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SUB1P53999 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.169e-10■■■■■ 34
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SUB1P53999 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.29e-10■■■■■ 34
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SUB1P53999 EIF4G1-222ENST00000442406 5129 ntTSL 1 (best)12.56□□□□□ -0.49e-10■■■■■ 34
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SUB1P53999 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.752e-6■■■■■ 33.9
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SUB1P53999 SOD2-203ENST00000367055 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 33.9
SUB1P53999 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.342e-6■■■■■ 33.9
SUB1P53999 COX7A2-207ENST00000481061 914 ntTSL 25.59□□□□□ -1.513e-7■■■■■ 33.9
SUB1P53999 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.185e-10■■■■■ 33.9
SUB1P53999 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.175e-10■■■■■ 33.9
SUB1P53999 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.515e-10■■■■■ 33.9
SUB1P53999 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.15e-10■■■■■ 33.9
SUB1P53999 SMC4-203ENST00000462668 4235 ntTSL 22.24□□□□□ -2.055e-10■■■■■ 33.9
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SUB1P53999 EIF5B-201ENST00000289371 5777 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.123e-6■■■■■ 33.8
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SUB1P53999 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 33.8
SUB1P53999 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 33.8
SUB1P53999 RRM2-212ENST00000615152 3434 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -12e-6■■■■■ 33.8
SUB1P53999 RRM2-201ENST00000304567 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.312e-6■■■■■ 33.8
SUB1P53999 RRM2-213ENST00000641198 3431 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.512e-6■■■■■ 33.8
SUB1P53999 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.674e-29■■■■■ 33.8
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SUB1P53999 EIF3L-209ENST00000460638 348 ntTSL 22.01□□□□□ -2.095e-29■■■■■ 33.8
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SUB1P53999 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.242e-12■■■■■ 33.7
SUB1P53999 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.052e-12■■■■■ 33.7
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SUB1P53999 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.773e-10■■■■■ 33.7
SUB1P53999 SNRPC-203ENST00000374018 600 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.13e-10■■■■■ 33.7
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SUB1P53999 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.593e-9■■■■■ 33.6
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SUB1P53999 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.097e-7■■■■■ 33.6
SUB1P53999 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.937e-7■■■■■ 33.6
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SUB1P53999 C14orf2-206ENST00000554287 361 ntTSL 34.93□□□□□ -1.625e-12■■■■■ 33.4
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SUB1P53999 GABARAP-202ENST00000570856 583 ntTSL 210.61□□□□□ -0.714e-7■■■■■ 33.4
SUB1P53999 AC120057.3-201ENST00000570760 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.914e-7■■■■■ 33.4
SUB1P53999 GABARAP-206ENST00000577035 762 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.934e-7■■■■■ 33.4
SUB1P53999 SNHG8-204ENST00000602573 570 ntTSL 24.01□□□□□ -1.779e-7■■■■■ 33.4
SUB1P53999 COX7C-204ENST00000510447 581 ntTSL 38.25□□□□□ -1.092e-22■■■■■ 33.4
SUB1P53999 COX7C-201ENST00000247655 666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.162e-22■■■■■ 33.4
SUB1P53999 COX7C-207ENST00000515763 347 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.162e-22■■■■■ 33.4
SUB1P53999 COX7C-203ENST00000509578 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.482e-22■■■■■ 33.4
SUB1P53999 COX7C-206ENST00000513124 693 ntTSL 53.8□□□□□ -1.82e-22■■■■■ 33.4
SUB1P53999 COX7C-202ENST00000505430 496 ntTSL 32.68□□□□□ -1.982e-22■■■■■ 33.4
SUB1P53999 COX7C-205ENST00000511472 369 ntTSL 22.4□□□□□ -2.032e-22■■■■■ 33.4
SUB1P53999 PDHA1-208ENST00000478795 791 ntTSL 28.98□□□□□ -0.973e-21■■■■■ 33.4
SUB1P53999 ECH1-215ENST00000601333 710 ntTSL 211.16□□□□□ -0.627e-10■■■■■ 33.4
SUB1P53999 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.777e-10■■■■■ 33.4
SUB1P53999 LARS-202ENST00000394434 4766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.064e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.84e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.74e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 PIN1-202ENST00000380889 1670 ntTSL 1 (best)18.42■□□□□ 0.544e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.334e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 04e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 ALDH18A1-203ENST00000483788 750 ntTSL 315.02■□□□□ -04e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.054e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.074e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 DLD-213ENST00000494441 707 ntTSL 314.47□□□□□ -0.094e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.194e-7■■■■■ 33.2
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