Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNT3P45378 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNT3P45378 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 585.5 ms