Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCC1P33527 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC1P33527 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC1P33527 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC1P33527 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ABCC1P33527 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
ABCC1P33527 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms