Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXA6P31267 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXA6P31267 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms