Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF2E1P29083 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms