Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB1P08034 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB1P08034 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB1P08034 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB1P08034 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB1P08034 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB1P08034 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB1P08034 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB1P08034 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB1P08034 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB1P08034 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB1P08034 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB1P08034 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB1P08034 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB1P08034 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB1P08034 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB1P08034 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB1P08034 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB1P08034 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB1P08034 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB1P08034 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB1P08034 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB1P08034 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB1P08034 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB1P08034 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB1P08034 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB1P08034 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB1P08034 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJB1P08034 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJB1P08034 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJB1P08034 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJB1P08034 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJB1P08034 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJB1P08034 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJB1P08034 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJB1P08034 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJB1P08034 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB1P08034 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB1P08034 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB1P08034 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB1P08034 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB1P08034 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB1P08034 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB1P08034 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB1P08034 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB1P08034 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB1P08034 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB1P08034 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB1P08034 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB1P08034 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB1P08034 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB1P08034 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB1P08034 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB1P08034 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB1P08034 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB1P08034 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB1P08034 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB1P08034 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB1P08034 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB1P08034 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB1P08034 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB1P08034 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB1P08034 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB1P08034 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB1P08034 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB1P08034 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB1P08034 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB1P08034 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB1P08034 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB1P08034 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB1P08034 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB1P08034 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB1P08034 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB1P08034 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB1P08034 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB1P08034 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB1P08034 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB1P08034 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB1P08034 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB1P08034 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB1P08034 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB1P08034 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB1P08034 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB1P08034 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB1P08034 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB1P08034 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB1P08034 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB1P08034 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB1P08034 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB1P08034 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB1P08034 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB1P08034 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB1P08034 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB1P08034 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB1P08034 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB1P08034 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB1P08034 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB1P08034 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GJB1P08034 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB1P08034 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms