Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CFAP69A5D8W1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP69A5D8W1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms