Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWA0

MED9, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED9Q9NWA0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED9Q9NWA0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED9Q9NWA0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED9Q9NWA0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED9Q9NWA0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED9Q9NWA0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED9Q9NWA0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED9Q9NWA0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED9Q9NWA0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED9Q9NWA0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED9Q9NWA0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED9Q9NWA0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED9Q9NWA0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED9Q9NWA0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED9Q9NWA0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED9Q9NWA0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MED9Q9NWA0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED9Q9NWA0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED9Q9NWA0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED9Q9NWA0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED9Q9NWA0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED9Q9NWA0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED9Q9NWA0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED9Q9NWA0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED9Q9NWA0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED9Q9NWA0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED9Q9NWA0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED9Q9NWA0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED9Q9NWA0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED9Q9NWA0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED9Q9NWA0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED9Q9NWA0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED9Q9NWA0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED9Q9NWA0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED9Q9NWA0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED9Q9NWA0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED9Q9NWA0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED9Q9NWA0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MED9Q9NWA0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED9Q9NWA0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED9Q9NWA0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED9Q9NWA0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED9Q9NWA0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED9Q9NWA0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED9Q9NWA0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED9Q9NWA0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED9Q9NWA0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED9Q9NWA0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED9Q9NWA0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED9Q9NWA0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED9Q9NWA0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED9Q9NWA0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED9Q9NWA0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED9Q9NWA0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED9Q9NWA0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED9Q9NWA0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED9Q9NWA0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED9Q9NWA0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED9Q9NWA0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED9Q9NWA0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED9Q9NWA0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED9Q9NWA0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED9Q9NWA0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED9Q9NWA0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED9Q9NWA0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED9Q9NWA0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED9Q9NWA0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED9Q9NWA0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED9Q9NWA0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED9Q9NWA0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED9Q9NWA0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED9Q9NWA0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED9Q9NWA0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED9Q9NWA0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED9Q9NWA0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED9Q9NWA0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED9Q9NWA0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED9Q9NWA0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED9Q9NWA0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED9Q9NWA0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED9Q9NWA0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED9Q9NWA0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED9Q9NWA0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED9Q9NWA0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED9Q9NWA0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED9Q9NWA0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED9Q9NWA0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED9Q9NWA0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED9Q9NWA0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED9Q9NWA0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED9Q9NWA0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED9Q9NWA0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED9Q9NWA0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED9Q9NWA0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED9Q9NWA0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED9Q9NWA0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED9Q9NWA0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED9Q9NWA0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED9Q9NWA0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED9Q9NWA0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms