Protein–RNA interactions for Protein: Q96T25

ZIC5, Zinc finger protein ZIC 5, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC5Q96T25 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ZIC5Q96T25 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ZIC5Q96T25 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ZIC5Q96T25 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZIC5Q96T25 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
ZIC5Q96T25 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
ZIC5Q96T25 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZIC5Q96T25 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
ZIC5Q96T25 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
ZIC5Q96T25 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZIC5Q96T25 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZIC5Q96T25 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZIC5Q96T25 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZIC5Q96T25 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZIC5Q96T25 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
ZIC5Q96T25 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZIC5Q96T25 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZIC5Q96T25 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZIC5Q96T25 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZIC5Q96T25 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ZIC5Q96T25 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ZIC5Q96T25 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ZIC5Q96T25 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ZIC5Q96T25 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZIC5Q96T25 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZIC5Q96T25 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZIC5Q96T25 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZIC5Q96T25 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZIC5Q96T25 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ZIC5Q96T25 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ZIC5Q96T25 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
ZIC5Q96T25 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZIC5Q96T25 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZIC5Q96T25 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ZIC5Q96T25 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ZIC5Q96T25 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ZIC5Q96T25 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
ZIC5Q96T25 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZIC5Q96T25 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
ZIC5Q96T25 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ZIC5Q96T25 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZIC5Q96T25 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZIC5Q96T25 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZIC5Q96T25 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZIC5Q96T25 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
ZIC5Q96T25 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZIC5Q96T25 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZIC5Q96T25 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ZIC5Q96T25 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ZIC5Q96T25 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ZIC5Q96T25 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZIC5Q96T25 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZIC5Q96T25 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ZIC5Q96T25 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ZIC5Q96T25 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
ZIC5Q96T25 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ZIC5Q96T25 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
ZIC5Q96T25 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZIC5Q96T25 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZIC5Q96T25 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZIC5Q96T25 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ZIC5Q96T25 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ZIC5Q96T25 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ZIC5Q96T25 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ZIC5Q96T25 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ZIC5Q96T25 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZIC5Q96T25 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ZIC5Q96T25 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ZIC5Q96T25 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ZIC5Q96T25 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ZIC5Q96T25 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ZIC5Q96T25 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ZIC5Q96T25 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ZIC5Q96T25 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ZIC5Q96T25 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ZIC5Q96T25 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ZIC5Q96T25 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ZIC5Q96T25 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ZIC5Q96T25 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ZIC5Q96T25 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
ZIC5Q96T25 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
ZIC5Q96T25 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ZIC5Q96T25 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ZIC5Q96T25 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ZIC5Q96T25 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ZIC5Q96T25 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ZIC5Q96T25 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ZIC5Q96T25 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ZIC5Q96T25 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ZIC5Q96T25 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ZIC5Q96T25 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZIC5Q96T25 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZIC5Q96T25 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZIC5Q96T25 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZIC5Q96T25 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
ZIC5Q96T25 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZIC5Q96T25 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ZIC5Q96T25 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ZIC5Q96T25 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
ZIC5Q96T25 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms