Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HHIPQ96QV1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HHIPQ96QV1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HHIPQ96QV1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HHIPQ96QV1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HHIPQ96QV1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HHIPQ96QV1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
HHIPQ96QV1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HHIPQ96QV1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HHIPQ96QV1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HHIPQ96QV1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HHIPQ96QV1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HHIPQ96QV1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
HHIPQ96QV1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HHIPQ96QV1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HHIPQ96QV1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HHIPQ96QV1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
HHIPQ96QV1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HHIPQ96QV1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HHIPQ96QV1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HHIPQ96QV1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HHIPQ96QV1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HHIPQ96QV1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HHIPQ96QV1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HHIPQ96QV1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HHIPQ96QV1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
HHIPQ96QV1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HHIPQ96QV1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HHIPQ96QV1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HHIPQ96QV1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HHIPQ96QV1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HHIPQ96QV1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HHIPQ96QV1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HHIPQ96QV1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HHIPQ96QV1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HHIPQ96QV1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HHIPQ96QV1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HHIPQ96QV1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HHIPQ96QV1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HHIPQ96QV1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HHIPQ96QV1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HHIPQ96QV1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HHIPQ96QV1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HHIPQ96QV1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HHIPQ96QV1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HHIPQ96QV1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HHIPQ96QV1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HHIPQ96QV1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HHIPQ96QV1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HHIPQ96QV1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HHIPQ96QV1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HHIPQ96QV1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HHIPQ96QV1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HHIPQ96QV1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HHIPQ96QV1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HHIPQ96QV1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HHIPQ96QV1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HHIPQ96QV1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HHIPQ96QV1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HHIPQ96QV1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HHIPQ96QV1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HHIPQ96QV1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HHIPQ96QV1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HHIPQ96QV1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HHIPQ96QV1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HHIPQ96QV1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HHIPQ96QV1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HHIPQ96QV1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HHIPQ96QV1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HHIPQ96QV1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HHIPQ96QV1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HHIPQ96QV1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HHIPQ96QV1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HHIPQ96QV1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HHIPQ96QV1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HHIPQ96QV1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HHIPQ96QV1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HHIPQ96QV1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HHIPQ96QV1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HHIPQ96QV1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HHIPQ96QV1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HHIPQ96QV1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HHIPQ96QV1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HHIPQ96QV1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HHIPQ96QV1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HHIPQ96QV1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HHIPQ96QV1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HHIPQ96QV1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HHIPQ96QV1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HHIPQ96QV1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HHIPQ96QV1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HHIPQ96QV1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HHIPQ96QV1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HHIPQ96QV1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HHIPQ96QV1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HHIPQ96QV1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HHIPQ96QV1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HHIPQ96QV1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HHIPQ96QV1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HHIPQ96QV1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms