Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SETXQ7Z333 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETXQ7Z333 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SETXQ7Z333 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SETXQ7Z333 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETXQ7Z333 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETXQ7Z333 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETXQ7Z333 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETXQ7Z333 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETXQ7Z333 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETXQ7Z333 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SETXQ7Z333 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SETXQ7Z333 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETXQ7Z333 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETXQ7Z333 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETXQ7Z333 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETXQ7Z333 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETXQ7Z333 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETXQ7Z333 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETXQ7Z333 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SETXQ7Z333 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SETXQ7Z333 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SETXQ7Z333 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETXQ7Z333 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETXQ7Z333 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SETXQ7Z333 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SETXQ7Z333 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETXQ7Z333 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETXQ7Z333 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETXQ7Z333 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETXQ7Z333 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETXQ7Z333 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETXQ7Z333 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETXQ7Z333 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETXQ7Z333 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETXQ7Z333 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETXQ7Z333 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETXQ7Z333 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETXQ7Z333 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETXQ7Z333 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SETXQ7Z333 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SETXQ7Z333 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SETXQ7Z333 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SETXQ7Z333 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SETXQ7Z333 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SETXQ7Z333 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETXQ7Z333 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETXQ7Z333 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETXQ7Z333 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SETXQ7Z333 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETXQ7Z333 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETXQ7Z333 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETXQ7Z333 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETXQ7Z333 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETXQ7Z333 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETXQ7Z333 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETXQ7Z333 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETXQ7Z333 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETXQ7Z333 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETXQ7Z333 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETXQ7Z333 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETXQ7Z333 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SETXQ7Z333 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETXQ7Z333 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SETXQ7Z333 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SETXQ7Z333 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETXQ7Z333 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SETXQ7Z333 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETXQ7Z333 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETXQ7Z333 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETXQ7Z333 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETXQ7Z333 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETXQ7Z333 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETXQ7Z333 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETXQ7Z333 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETXQ7Z333 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SETXQ7Z333 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SETXQ7Z333 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SETXQ7Z333 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SETXQ7Z333 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SETXQ7Z333 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SETXQ7Z333 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETXQ7Z333 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETXQ7Z333 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETXQ7Z333 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SETXQ7Z333 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETXQ7Z333 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETXQ7Z333 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SETXQ7Z333 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETXQ7Z333 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETXQ7Z333 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETXQ7Z333 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETXQ7Z333 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETXQ7Z333 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETXQ7Z333 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETXQ7Z333 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETXQ7Z333 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETXQ7Z333 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETXQ7Z333 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETXQ7Z333 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms