Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW78

UQCC3, Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCC3Q6UW78 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UQCC3Q6UW78 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UQCC3Q6UW78 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UQCC3Q6UW78 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UQCC3Q6UW78 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UQCC3Q6UW78 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UQCC3Q6UW78 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UQCC3Q6UW78 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UQCC3Q6UW78 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UQCC3Q6UW78 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UQCC3Q6UW78 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UQCC3Q6UW78 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UQCC3Q6UW78 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UQCC3Q6UW78 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UQCC3Q6UW78 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UQCC3Q6UW78 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UQCC3Q6UW78 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UQCC3Q6UW78 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UQCC3Q6UW78 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UQCC3Q6UW78 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UQCC3Q6UW78 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UQCC3Q6UW78 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UQCC3Q6UW78 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UQCC3Q6UW78 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UQCC3Q6UW78 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UQCC3Q6UW78 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UQCC3Q6UW78 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UQCC3Q6UW78 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UQCC3Q6UW78 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UQCC3Q6UW78 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UQCC3Q6UW78 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UQCC3Q6UW78 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UQCC3Q6UW78 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UQCC3Q6UW78 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UQCC3Q6UW78 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UQCC3Q6UW78 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UQCC3Q6UW78 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UQCC3Q6UW78 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UQCC3Q6UW78 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UQCC3Q6UW78 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UQCC3Q6UW78 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UQCC3Q6UW78 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UQCC3Q6UW78 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UQCC3Q6UW78 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UQCC3Q6UW78 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UQCC3Q6UW78 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UQCC3Q6UW78 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UQCC3Q6UW78 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UQCC3Q6UW78 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UQCC3Q6UW78 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UQCC3Q6UW78 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UQCC3Q6UW78 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UQCC3Q6UW78 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UQCC3Q6UW78 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UQCC3Q6UW78 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UQCC3Q6UW78 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UQCC3Q6UW78 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UQCC3Q6UW78 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UQCC3Q6UW78 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UQCC3Q6UW78 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UQCC3Q6UW78 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UQCC3Q6UW78 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UQCC3Q6UW78 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UQCC3Q6UW78 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCC3Q6UW78 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCC3Q6UW78 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCC3Q6UW78 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCC3Q6UW78 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCC3Q6UW78 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
UQCC3Q6UW78 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UQCC3Q6UW78 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UQCC3Q6UW78 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UQCC3Q6UW78 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCC3Q6UW78 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCC3Q6UW78 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCC3Q6UW78 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UQCC3Q6UW78 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UQCC3Q6UW78 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UQCC3Q6UW78 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UQCC3Q6UW78 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UQCC3Q6UW78 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UQCC3Q6UW78 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCC3Q6UW78 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCC3Q6UW78 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCC3Q6UW78 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCC3Q6UW78 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UQCC3Q6UW78 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UQCC3Q6UW78 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCC3Q6UW78 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UQCC3Q6UW78 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UQCC3Q6UW78 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UQCC3Q6UW78 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UQCC3Q6UW78 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UQCC3Q6UW78 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UQCC3Q6UW78 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UQCC3Q6UW78 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UQCC3Q6UW78 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UQCC3Q6UW78 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UQCC3Q6UW78 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UQCC3Q6UW78 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms