Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q6Q795 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q6Q795 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q6Q795 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q6Q795 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q6Q795 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q6Q795 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q6Q795 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Q6Q795 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6Q795 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6Q795 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q6Q795 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q6Q795 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q6Q795 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q6Q795 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q6Q795 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q6Q795 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q6Q795 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q6Q795 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q6Q795 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6Q795 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6Q795 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q6Q795 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6Q795 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6Q795 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q6Q795 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6Q795 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6Q795 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6Q795 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q6Q795 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q6Q795 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q6Q795 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q6Q795 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q6Q795 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q6Q795 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q6Q795 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q6Q795 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6Q795 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6Q795 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6Q795 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6Q795 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6Q795 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6Q795 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6Q795 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6Q795 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6Q795 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6Q795 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6Q795 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6Q795 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6Q795 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q6Q795 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q6Q795 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6Q795 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6Q795 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6Q795 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6Q795 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q6Q795 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q6Q795 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q6Q795 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q6Q795 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q6Q795 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q6Q795 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q6Q795 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q6Q795 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6Q795 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6Q795 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6Q795 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6Q795 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6Q795 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6Q795 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6Q795 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6Q795 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6Q795 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6Q795 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6Q795 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6Q795 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6Q795 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6Q795 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6Q795 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q6Q795 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6Q795 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6Q795 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6Q795 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6Q795 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6Q795 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q6Q795 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q6Q795 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q6Q795 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6Q795 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6Q795 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6Q795 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6Q795 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6Q795 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6Q795 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6Q795 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6Q795 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6Q795 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6Q795 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6Q795 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6Q795 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms