Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q1T7F1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q1T7F1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q1T7F1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q1T7F1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q1T7F1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q1T7F1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q1T7F1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q1T7F1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q1T7F1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q1T7F1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q1T7F1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q1T7F1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q1T7F1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q1T7F1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q1T7F1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q1T7F1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q1T7F1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q1T7F1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q1T7F1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q1T7F1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q1T7F1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q1T7F1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q1T7F1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q1T7F1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q1T7F1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q1T7F1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q1T7F1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q1T7F1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q1T7F1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q1T7F1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q1T7F1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q1T7F1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q1T7F1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q1T7F1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q1T7F1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q1T7F1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q1T7F1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q1T7F1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q1T7F1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q1T7F1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q1T7F1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q1T7F1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q1T7F1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q1T7F1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q1T7F1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q1T7F1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q1T7F1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q1T7F1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q1T7F1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q1T7F1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q1T7F1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q1T7F1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q1T7F1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q1T7F1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q1T7F1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q1T7F1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q1T7F1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q1T7F1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q1T7F1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q1T7F1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q1T7F1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q1T7F1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q1T7F1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q1T7F1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q1T7F1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q1T7F1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q1T7F1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q1T7F1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q1T7F1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q1T7F1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q1T7F1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q1T7F1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q1T7F1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q1T7F1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q1T7F1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q1T7F1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q1T7F1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q1T7F1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q1T7F1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q1T7F1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q1T7F1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q1T7F1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q1T7F1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q1T7F1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q1T7F1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q1T7F1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q1T7F1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q1T7F1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q1T7F1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q1T7F1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q1T7F1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q1T7F1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q1T7F1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q1T7F1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q1T7F1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q1T7F1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q1T7F1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q1T7F1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q1T7F1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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