Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCGB2A2Q13296 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCGB2A2Q13296 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCGB2A2Q13296 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCGB2A2Q13296 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCGB2A2Q13296 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCGB2A2Q13296 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCGB2A2Q13296 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCGB2A2Q13296 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCGB2A2Q13296 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCGB2A2Q13296 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCGB2A2Q13296 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCGB2A2Q13296 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCGB2A2Q13296 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCGB2A2Q13296 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SCGB2A2Q13296 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCGB2A2Q13296 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCGB2A2Q13296 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCGB2A2Q13296 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCGB2A2Q13296 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCGB2A2Q13296 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCGB2A2Q13296 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCGB2A2Q13296 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCGB2A2Q13296 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCGB2A2Q13296 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCGB2A2Q13296 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCGB2A2Q13296 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCGB2A2Q13296 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCGB2A2Q13296 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCGB2A2Q13296 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCGB2A2Q13296 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCGB2A2Q13296 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCGB2A2Q13296 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCGB2A2Q13296 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCGB2A2Q13296 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCGB2A2Q13296 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCGB2A2Q13296 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCGB2A2Q13296 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCGB2A2Q13296 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCGB2A2Q13296 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCGB2A2Q13296 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCGB2A2Q13296 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCGB2A2Q13296 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCGB2A2Q13296 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCGB2A2Q13296 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCGB2A2Q13296 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCGB2A2Q13296 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCGB2A2Q13296 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCGB2A2Q13296 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCGB2A2Q13296 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCGB2A2Q13296 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCGB2A2Q13296 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCGB2A2Q13296 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCGB2A2Q13296 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCGB2A2Q13296 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCGB2A2Q13296 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCGB2A2Q13296 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCGB2A2Q13296 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCGB2A2Q13296 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCGB2A2Q13296 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCGB2A2Q13296 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCGB2A2Q13296 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCGB2A2Q13296 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCGB2A2Q13296 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCGB2A2Q13296 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCGB2A2Q13296 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCGB2A2Q13296 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCGB2A2Q13296 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCGB2A2Q13296 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCGB2A2Q13296 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCGB2A2Q13296 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCGB2A2Q13296 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCGB2A2Q13296 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCGB2A2Q13296 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCGB2A2Q13296 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCGB2A2Q13296 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCGB2A2Q13296 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCGB2A2Q13296 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCGB2A2Q13296 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCGB2A2Q13296 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCGB2A2Q13296 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCGB2A2Q13296 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCGB2A2Q13296 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCGB2A2Q13296 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCGB2A2Q13296 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCGB2A2Q13296 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCGB2A2Q13296 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCGB2A2Q13296 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCGB2A2Q13296 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCGB2A2Q13296 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCGB2A2Q13296 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCGB2A2Q13296 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCGB2A2Q13296 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCGB2A2Q13296 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCGB2A2Q13296 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCGB2A2Q13296 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCGB2A2Q13296 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCGB2A2Q13296 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCGB2A2Q13296 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCGB2A2Q13296 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
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