Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TP53BP1Q12888 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TP53BP1Q12888 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TP53BP1Q12888 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TP53BP1Q12888 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TP53BP1Q12888 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TP53BP1Q12888 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TP53BP1Q12888 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TP53BP1Q12888 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TP53BP1Q12888 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TP53BP1Q12888 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TP53BP1Q12888 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TP53BP1Q12888 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TP53BP1Q12888 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TP53BP1Q12888 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TP53BP1Q12888 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TP53BP1Q12888 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TP53BP1Q12888 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TP53BP1Q12888 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TP53BP1Q12888 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TP53BP1Q12888 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TP53BP1Q12888 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TP53BP1Q12888 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TP53BP1Q12888 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TP53BP1Q12888 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TP53BP1Q12888 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TP53BP1Q12888 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TP53BP1Q12888 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TP53BP1Q12888 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TP53BP1Q12888 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TP53BP1Q12888 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TP53BP1Q12888 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TP53BP1Q12888 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TP53BP1Q12888 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TP53BP1Q12888 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TP53BP1Q12888 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TP53BP1Q12888 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TP53BP1Q12888 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TP53BP1Q12888 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TP53BP1Q12888 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TP53BP1Q12888 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TP53BP1Q12888 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TP53BP1Q12888 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TP53BP1Q12888 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TP53BP1Q12888 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TP53BP1Q12888 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TP53BP1Q12888 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TP53BP1Q12888 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TP53BP1Q12888 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TP53BP1Q12888 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TP53BP1Q12888 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TP53BP1Q12888 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TP53BP1Q12888 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TP53BP1Q12888 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TP53BP1Q12888 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TP53BP1Q12888 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TP53BP1Q12888 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TP53BP1Q12888 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TP53BP1Q12888 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TP53BP1Q12888 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TP53BP1Q12888 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TP53BP1Q12888 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TP53BP1Q12888 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TP53BP1Q12888 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TP53BP1Q12888 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TP53BP1Q12888 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TP53BP1Q12888 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TP53BP1Q12888 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TP53BP1Q12888 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TP53BP1Q12888 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TP53BP1Q12888 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TP53BP1Q12888 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TP53BP1Q12888 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TP53BP1Q12888 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TP53BP1Q12888 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TP53BP1Q12888 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TP53BP1Q12888 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TP53BP1Q12888 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TP53BP1Q12888 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TP53BP1Q12888 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TP53BP1Q12888 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
TP53BP1Q12888 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TP53BP1Q12888 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TP53BP1Q12888 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TP53BP1Q12888 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TP53BP1Q12888 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TP53BP1Q12888 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TP53BP1Q12888 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TP53BP1Q12888 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TP53BP1Q12888 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TP53BP1Q12888 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TP53BP1Q12888 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TP53BP1Q12888 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TP53BP1Q12888 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TP53BP1Q12888 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TP53BP1Q12888 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TP53BP1Q12888 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TP53BP1Q12888 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TP53BP1Q12888 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TP53BP1Q12888 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
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