Protein–RNA interactions for Protein: Q03938

ZNF90, Zinc finger protein 90, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF90Q03938 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF90Q03938 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF90Q03938 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF90Q03938 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF90Q03938 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF90Q03938 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF90Q03938 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF90Q03938 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF90Q03938 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF90Q03938 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF90Q03938 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF90Q03938 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF90Q03938 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF90Q03938 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF90Q03938 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF90Q03938 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF90Q03938 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF90Q03938 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF90Q03938 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF90Q03938 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF90Q03938 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF90Q03938 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF90Q03938 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF90Q03938 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF90Q03938 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF90Q03938 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF90Q03938 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF90Q03938 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF90Q03938 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF90Q03938 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF90Q03938 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF90Q03938 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF90Q03938 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF90Q03938 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF90Q03938 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF90Q03938 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF90Q03938 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF90Q03938 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF90Q03938 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF90Q03938 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF90Q03938 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF90Q03938 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF90Q03938 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF90Q03938 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF90Q03938 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF90Q03938 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF90Q03938 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF90Q03938 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF90Q03938 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF90Q03938 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF90Q03938 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF90Q03938 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF90Q03938 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF90Q03938 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF90Q03938 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF90Q03938 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF90Q03938 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF90Q03938 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF90Q03938 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF90Q03938 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF90Q03938 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF90Q03938 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF90Q03938 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF90Q03938 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF90Q03938 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF90Q03938 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF90Q03938 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF90Q03938 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF90Q03938 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF90Q03938 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF90Q03938 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF90Q03938 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF90Q03938 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF90Q03938 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF90Q03938 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF90Q03938 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF90Q03938 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF90Q03938 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF90Q03938 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF90Q03938 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF90Q03938 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF90Q03938 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF90Q03938 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF90Q03938 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF90Q03938 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF90Q03938 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF90Q03938 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF90Q03938 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF90Q03938 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZNF90Q03938 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZNF90Q03938 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF90Q03938 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF90Q03938 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF90Q03938 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF90Q03938 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF90Q03938 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF90Q03938 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF90Q03938 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF90Q03938 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF90Q03938 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms