Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM258P61165 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM258P61165 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM258P61165 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM258P61165 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM258P61165 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM258P61165 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM258P61165 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM258P61165 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM258P61165 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM258P61165 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM258P61165 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM258P61165 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM258P61165 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM258P61165 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM258P61165 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM258P61165 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM258P61165 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM258P61165 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM258P61165 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM258P61165 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM258P61165 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM258P61165 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM258P61165 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM258P61165 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM258P61165 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM258P61165 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM258P61165 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM258P61165 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM258P61165 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM258P61165 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM258P61165 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM258P61165 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM258P61165 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM258P61165 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM258P61165 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM258P61165 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM258P61165 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM258P61165 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM258P61165 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM258P61165 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM258P61165 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM258P61165 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM258P61165 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM258P61165 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM258P61165 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM258P61165 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM258P61165 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM258P61165 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM258P61165 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM258P61165 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM258P61165 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM258P61165 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM258P61165 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM258P61165 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM258P61165 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM258P61165 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM258P61165 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM258P61165 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM258P61165 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM258P61165 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM258P61165 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM258P61165 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM258P61165 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM258P61165 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM258P61165 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM258P61165 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM258P61165 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM258P61165 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM258P61165 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM258P61165 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM258P61165 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM258P61165 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM258P61165 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM258P61165 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM258P61165 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM258P61165 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM258P61165 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM258P61165 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM258P61165 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM258P61165 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM258P61165 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM258P61165 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM258P61165 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM258P61165 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM258P61165 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM258P61165 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM258P61165 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM258P61165 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM258P61165 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM258P61165 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM258P61165 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM258P61165 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM258P61165 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM258P61165 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM258P61165 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM258P61165 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM258P61165 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM258P61165 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM258P61165 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms