Protein–RNA interactions for Protein: P06310

IGKV2-30, Immunoglobulin kappa variable 2-30, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV2-30P06310 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGKV2-30P06310 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGKV2-30P06310 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGKV2-30P06310 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGKV2-30P06310 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV2-30P06310 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV2-30P06310 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV2-30P06310 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV2-30P06310 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV2-30P06310 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV2-30P06310 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV2-30P06310 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV2-30P06310 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV2-30P06310 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV2-30P06310 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV2-30P06310 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV2-30P06310 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV2-30P06310 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV2-30P06310 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV2-30P06310 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGKV2-30P06310 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGKV2-30P06310 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGKV2-30P06310 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGKV2-30P06310 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGKV2-30P06310 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGKV2-30P06310 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGKV2-30P06310 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGKV2-30P06310 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV2-30P06310 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV2-30P06310 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV2-30P06310 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IGKV2-30P06310 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGKV2-30P06310 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGKV2-30P06310 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGKV2-30P06310 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGKV2-30P06310 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGKV2-30P06310 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IGKV2-30P06310 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV2-30P06310 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV2-30P06310 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV2-30P06310 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV2-30P06310 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV2-30P06310 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV2-30P06310 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV2-30P06310 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV2-30P06310 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV2-30P06310 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV2-30P06310 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV2-30P06310 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV2-30P06310 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV2-30P06310 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV2-30P06310 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV2-30P06310 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV2-30P06310 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV2-30P06310 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV2-30P06310 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV2-30P06310 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGKV2-30P06310 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGKV2-30P06310 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGKV2-30P06310 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV2-30P06310 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV2-30P06310 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV2-30P06310 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV2-30P06310 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV2-30P06310 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV2-30P06310 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV2-30P06310 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV2-30P06310 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV2-30P06310 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV2-30P06310 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV2-30P06310 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGKV2-30P06310 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGKV2-30P06310 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IGKV2-30P06310 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGKV2-30P06310 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV2-30P06310 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV2-30P06310 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV2-30P06310 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV2-30P06310 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
IGKV2-30P06310 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IGKV2-30P06310 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IGKV2-30P06310 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IGKV2-30P06310 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IGKV2-30P06310 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IGKV2-30P06310 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IGKV2-30P06310 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IGKV2-30P06310 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IGKV2-30P06310 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IGKV2-30P06310 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IGKV2-30P06310 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IGKV2-30P06310 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IGKV2-30P06310 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IGKV2-30P06310 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IGKV2-30P06310 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IGKV2-30P06310 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IGKV2-30P06310 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IGKV2-30P06310 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IGKV2-30P06310 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IGKV2-30P06310 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IGKV2-30P06310 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms