Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SH3BP5O60239 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SH3BP5O60239 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SH3BP5O60239 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SH3BP5O60239 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SH3BP5O60239 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH3BP5O60239 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH3BP5O60239 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH3BP5O60239 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH3BP5O60239 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH3BP5O60239 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SH3BP5O60239 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH3BP5O60239 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SH3BP5O60239 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH3BP5O60239 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SH3BP5O60239 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SH3BP5O60239 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SH3BP5O60239 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SH3BP5O60239 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SH3BP5O60239 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH3BP5O60239 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH3BP5O60239 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH3BP5O60239 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SH3BP5O60239 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SH3BP5O60239 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SH3BP5O60239 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH3BP5O60239 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH3BP5O60239 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3BP5O60239 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3BP5O60239 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3BP5O60239 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH3BP5O60239 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH3BP5O60239 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH3BP5O60239 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH3BP5O60239 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH3BP5O60239 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH3BP5O60239 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SH3BP5O60239 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SH3BP5O60239 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SH3BP5O60239 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SH3BP5O60239 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SH3BP5O60239 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SH3BP5O60239 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SH3BP5O60239 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SH3BP5O60239 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SH3BP5O60239 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SH3BP5O60239 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SH3BP5O60239 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SH3BP5O60239 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SH3BP5O60239 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SH3BP5O60239 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SH3BP5O60239 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SH3BP5O60239 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SH3BP5O60239 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SH3BP5O60239 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SH3BP5O60239 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SH3BP5O60239 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SH3BP5O60239 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SH3BP5O60239 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH3BP5O60239 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SH3BP5O60239 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SH3BP5O60239 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SH3BP5O60239 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SH3BP5O60239 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SH3BP5O60239 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SH3BP5O60239 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SH3BP5O60239 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SH3BP5O60239 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SH3BP5O60239 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SH3BP5O60239 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SH3BP5O60239 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SH3BP5O60239 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH3BP5O60239 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH3BP5O60239 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH3BP5O60239 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH3BP5O60239 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH3BP5O60239 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SH3BP5O60239 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH3BP5O60239 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH3BP5O60239 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SH3BP5O60239 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3BP5O60239 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SH3BP5O60239 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH3BP5O60239 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH3BP5O60239 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3BP5O60239 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SH3BP5O60239 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SH3BP5O60239 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SH3BP5O60239 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3BP5O60239 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3BP5O60239 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3BP5O60239 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3BP5O60239 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3BP5O60239 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3BP5O60239 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH3BP5O60239 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH3BP5O60239 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH3BP5O60239 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SH3BP5O60239 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SH3BP5O60239 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms