Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.982e-17■■■■■ 84.9
DDX3XO00571 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.472e-17■■■■■ 84.9
DDX3XO00571 MRPL40-202ENST00000443660 954 ntTSL 214.45□□□□□ -0.12e-17■■■■■ 84.9
DDX3XO00571 PPP2R2C-202ENST00000335585 4092 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.462e-17■■■■■ 84.9
DDX3XO00571 DPH3-204ENST00000488423 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.862e-17■■■■■ 84.9
DDX3XO00571 DPH3-202ENST00000383775 3052 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.92e-17■■■■■ 84.9
DDX3XO00571 SMIM20-203ENST00000515764 773 ntTSL 58.02□□□□□ -1.132e-17■■■■■ 84.9
DDX3XO00571 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.182e-17■■■■■ 84.9
DDX3XO00571 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.211e-8■■■■■ 82.8
DDX3XO00571 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.121e-8■■■■■ 82.8
DDX3XO00571 GRINA-205ENST00000529301 1075 ntTSL 321.69■■□□□ 1.061e-8■■■■■ 82.8
DDX3XO00571 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.271e-7■■■■■ 82.7
DDX3XO00571 APOC1-203ENST00000588802 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 82.7
DDX3XO00571 APOC1-205ENST00000589781 273 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 82.7
DDX3XO00571 APOC1-202ENST00000588750 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.051e-7■■■■■ 82.7
DDX3XO00571 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.461e-7■■■■■ 82.6
DDX3XO00571 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.261e-7■■■■■ 82.6
DDX3XO00571 FAM238C-203ENST00000640121 3620 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 82.6
DDX3XO00571 FAM238C-201ENST00000638416 868 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.611e-7■■■■■ 82.6
DDX3XO00571 FAM238C-205ENST00000640641 391 ntBASIC9.14□□□□□ -0.951e-7■■■■■ 82.6
DDX3XO00571 ZNF664-208ENST00000540009 753 ntTSL 323.41■■□□□ 1.343e-13■■■■■ 82.6
DDX3XO00571 ZNF664-212ENST00000542820 802 ntTSL 1 (best)22.7■■□□□ 1.223e-13■■■■■ 82.6
DDX3XO00571 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.422e-46■■■■■ 82.6
DDX3XO00571 APOE-204ENST00000446996 737 ntTSL 222.89■■□□□ 1.252e-46■■■■■ 82.6
DDX3XO00571 APOE-203ENST00000434152 864 ntTSL 221.02■□□□□ 0.962e-46■■■■■ 82.6
DDX3XO00571 ARIH2-204ENST00000433170 560 ntTSL 420.6■□□□□ 0.897e-10■■■■■ 82.5
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DDX3XO00571 ARIH2-218ENST00000474936 695 ntTSL 220.6■□□□□ 0.897e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-224ENST00000486316 406 ntTSL 419■□□□□ 0.637e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-227ENST00000490095 1001 ntTSL 519■□□□□ 0.637e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-202ENST00000420814 884 ntTSL 319■□□□□ 0.637e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-211ENST00000463738 528 ntTSL 419■□□□□ 0.637e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-230ENST00000495761 569 ntTSL 318.67■□□□□ 0.587e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-228ENST00000492077 731 ntTSL 218.34■□□□□ 0.537e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-219ENST00000478224 507 ntTSL 317.79■□□□□ 0.447e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-206ENST00000449729 678 ntTSL 217.29■□□□□ 0.367e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.277e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-222ENST00000483333 674 ntTSL 516.29■□□□□ 0.27e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-221ENST00000482427 556 ntTSL 416.29■□□□□ 0.27e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-217ENST00000474618 566 ntTSL 316.29■□□□□ 0.27e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-231ENST00000498314 649 ntTSL 416.03■□□□□ 0.167e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-203ENST00000430423 753 ntTSL 216.03■□□□□ 0.167e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-208ENST00000452882 598 ntTSL 315.99■□□□□ 0.157e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-201ENST00000356401 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.627e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 GALNT11-212ENST00000482812 580 ntTSL 423.91■■□□□ 1.425e-14■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.65e-14■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 GALNT11-210ENST00000447778 1231 ntTSL 517.68■□□□□ 0.425e-14■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 GALNT11-209ENST00000446096 521 ntTSL 317.49■□□□□ 0.395e-14■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 GALNT11-204ENST00000423337 580 ntTSL 315.83■□□□□ 0.125e-14■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 GALNT11-206ENST00000431668 626 ntTSL 315.06■□□□□ 05e-14■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.418e-17■■■■■ 82.3
DDX3XO00571 RAB9A-201ENST00000243325 393 ntTSL 316.93■□□□□ 0.38e-17■■■■■ 82.3
DDX3XO00571 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.38e-17■■■■■ 82.3
DDX3XO00571 MRPL40-203ENST00000471259 942 ntTSL 211.01□□□□□ -0.654e-17■■■■■ 82.3
DDX3XO00571 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.929e-9■■■■■ 82.2
DDX3XO00571 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.779e-9■■■■■ 82.2
DDX3XO00571 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.689e-9■■■■■ 82.2
DDX3XO00571 COPS9-202ENST00000403160 609 ntTSL 217.19■□□□□ 0.348e-9■■■■■ 81
DDX3XO00571 GSTK1-208ENST00000489654 875 ntTSL 217.89■□□□□ 0.452e-32■■■■■ 80.8
DDX3XO00571 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.372e-32■■■■■ 80.8
DDX3XO00571 GSTK1-209ENST00000494735 832 ntTSL 216.87■□□□□ 0.292e-32■■■■■ 80.8
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DDX3XO00571 GSTK1-201ENST00000358406 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.242e-32■■■■■ 80.8
DDX3XO00571 GSTK1-204ENST00000442394 2219 ntTSL 512.76□□□□□ -0.372e-32■■■■■ 80.8
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DDX3XO00571 GSTK1-206ENST00000473649 2692 ntTSL 29.53□□□□□ -0.882e-32■■■■■ 80.8
DDX3XO00571 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.618e-14■■■■■ 80.6
DDX3XO00571 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.074e-11■■■■■ 80.4
DDX3XO00571 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.974e-11■■■■■ 80.4
DDX3XO00571 ABHD14A-203ENST00000474575 1064 ntTSL 220.99■□□□□ 0.954e-11■■■■■ 80.4
DDX3XO00571 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.864e-11■■■■■ 80.4
DDX3XO00571 ABHD14A-206ENST00000497864 802 ntTSL 219.6■□□□□ 0.734e-11■■■■■ 80.4
DDX3XO00571 ABHD14A-205ENST00000494478 626 ntTSL 312.99□□□□□ -0.334e-11■■■■■ 80.4
DDX3XO00571 CDS2-204ENST00000467923 783 ntTSL 323.82■■□□□ 1.44e-15■■■■■ 80.3
DDX3XO00571 CDS2-202ENST00000450570 945 ntTSL 323.71■■□□□ 1.394e-15■■■■■ 80.3
DDX3XO00571 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.024e-15■■■■■ 80.3
DDX3XO00571 CDS2-205ENST00000468817 2706 ntTSL 214.7□□□□□ -0.064e-15■■■■■ 80.3
DDX3XO00571 CDS2-206ENST00000486875 709 ntTSL 212.49□□□□□ -0.414e-15■■■■■ 80.3
DDX3XO00571 AREG-201ENST00000395748 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.361e-11■■■■■ 80
DDX3XO00571 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.716e-18■■■■■ 79.8
DDX3XO00571 TP73-AS1-204ENST00000452079 6358 ntTSL 1 (best)15.19■□□□□ 0.026e-18■■■■■ 79.8
DDX3XO00571 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -09e-27■■■■■ 79.7
DDX3XO00571 SYCP2L-202ENST00000341041 3069 ntTSL 213.02□□□□□ -0.339e-27■■■■■ 79.7
DDX3XO00571 UBE2D4-205ENST00000443780 743 ntTSL 320.83■□□□□ 0.933e-16■■■■■ 79.6
DDX3XO00571 UBE2D4-207ENST00000450743 849 ntTSL 220.83■□□□□ 0.933e-16■■■■■ 79.6
DDX3XO00571 UBE2D4-208ENST00000454350 789 ntTSL 218.71■□□□□ 0.593e-16■■■■■ 79.6
DDX3XO00571 UBE2D4-209ENST00000454428 288 ntTSL 316.73■□□□□ 0.273e-16■■■■■ 79.6
DDX3XO00571 UBE2D4-202ENST00000415051 921 ntTSL 316.73■□□□□ 0.273e-16■■■■■ 79.6
DDX3XO00571 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.183e-16■■■■■ 79.6
DDX3XO00571 UBE2D4-204ENST00000440899 1040 ntTSL 511.66□□□□□ -0.543e-16■■■■■ 79.6
DDX3XO00571 UBE2D4-206ENST00000446008 783 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.883e-16■■■■■ 79.6
DDX3XO00571 UBE2D4-203ENST00000440652 1299 ntTSL 27.29□□□□□ -1.243e-16■■■■■ 79.6
DDX3XO00571 GTF3A-203ENST00000435781 688 ntTSL 521.71■■□□□ 1.075e-21■■■■■ 78.7
DDX3XO00571 GTF3A-202ENST00000419181 1191 ntTSL 1 (best)20.87■□□□□ 0.935e-21■■■■■ 78.7
DDX3XO00571 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.825e-21■■■■■ 78.7
DDX3XO00571 GTF3A-204ENST00000438571 792 ntTSL 518.24■□□□□ 0.515e-21■■■■■ 78.7
DDX3XO00571 APOE-205ENST00000485628 771 ntTSL 1 (best)16.8■□□□□ 0.282e-11■■■■■ 78.5
DDX3XO00571 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.046e-13■■■■■ 78.5
DDX3XO00571 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.896e-13■■■■■ 78.5
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