RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467923.5

CDS2-204, Transcript of CDP-diacylglycerol synthase 2, humanhuman

TSL 3

Gene CDS2, Length 783 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDS2-204ENST00000467923 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.38■■■■■ 7.1
CDS2-204ENST00000467923 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.17■■■■■ 6.1
CDS2-204ENST00000467923 ABCC9O60706 1549 aa53.14■■■■■ 6.1
CDS2-204ENST00000467923 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.64■■■■■ 5.7
CDS2-204ENST00000467923 NACADO15069 1562 aa50.34■■■■■ 5.65
CDS2-204ENST00000467923 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.19■■■■■ 5.63
CDS2-204ENST00000467923 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.9■■■■■ 5.58
CDS2-204ENST00000467923 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.72■■■■■ 5.55
CDS2-204ENST00000467923 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.57■■■■■ 5.53
CDS2-204ENST00000467923 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.35■■■■■ 5.49
CDS2-204ENST00000467923 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.18■■■■■ 5.46
CDS2-204ENST00000467923 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.12■■■■■ 5.45
CDS2-204ENST00000467923 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.09■■■■■ 5.45
CDS2-204ENST00000467923 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.55■■■■■ 5.36
CDS2-204ENST00000467923 SCRIBQ14160 1630 aa48.41■■■■■ 5.34
CDS2-204ENST00000467923 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.99■■■■■ 5.27
CDS2-204ENST00000467923 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.92■■■■■ 5.26
CDS2-204ENST00000467923 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.91■■■■■ 5.26
CDS2-204ENST00000467923 NCAPD3P42695 1498 aa46.53■■■■■ 5.04
CDS2-204ENST00000467923 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.35■■■■■ 5.01
CDS2-204ENST00000467923 SMARCA4P51532 1647 aa46.24■■■■■ 4.99
CDS2-204ENST00000467923 SMARCA2P51531 1590 aa46.2■■■■■ 4.99
CDS2-204ENST00000467923 HMGXB3Q12766 1538 aa46.08■■■■■ 4.97
CDS2-204ENST00000467923 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.07■■■■■ 4.97
CDS2-204ENST00000467923 ERCC6Q03468 1493 aa45.9■■■■■ 4.94
CDS2-204ENST00000467923 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.87■■■■■ 4.93
CDS2-204ENST00000467923 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.84■■■■■ 4.93
CDS2-204ENST00000467923 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.84■■■■■ 4.93
CDS2-204ENST00000467923 CUX2O14529 1486 aa45.83■■■■■ 4.93
CDS2-204ENST00000467923 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.71■■■■■ 4.91
CDS2-204ENST00000467923 NESP48681 1621 aa45.66■■■■■ 4.9
CDS2-204ENST00000467923 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.39■■■■■ 4.86
CDS2-204ENST00000467923 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.21■■■■■ 4.83
CDS2-204ENST00000467923 WIZO95785 1651 aa45.13■■■■■ 4.82
CDS2-204ENST00000467923 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.13■■■■■ 4.82
CDS2-204ENST00000467923 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.12■■■■■ 4.81
CDS2-204ENST00000467923 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.99■■■■■ 4.79
CDS2-204ENST00000467923 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.85■■■■■ 4.77
CDS2-204ENST00000467923 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.72■■■■■ 4.75
CDS2-204ENST00000467923 WDR62O43379 1518 aa44.6■■■■■ 4.73
CDS2-204ENST00000467923 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.59■■■■■ 4.73
CDS2-204ENST00000467923 CFTRP13569 1480 aa44.59■■■■■ 4.73
CDS2-204ENST00000467923 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.56■■■■■ 4.72
CDS2-204ENST00000467923 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.53■■■■■ 4.72
CDS2-204ENST00000467923 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.15■■■■■ 4.66
CDS2-204ENST00000467923 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.14■■■■■ 4.66
CDS2-204ENST00000467923 PRDM2Q13029 1718 aa43.96■■■■■ 4.63
CDS2-204ENST00000467923 OSCARQ8IYS5 282 aa43.88■■■■■ 4.62
CDS2-204ENST00000467923 TRIM41Q8WV44 630 aa43.77■■■■■ 4.6
CDS2-204ENST00000467923 IFT140Q96RY7 1462 aa43.71■■■■■ 4.59
CDS2-204ENST00000467923 ABCC8Q09428 1581 aa43.7■■■■■ 4.59
CDS2-204ENST00000467923 TOPBP1Q92547 1522 aa43.68■■■■■ 4.58
CDS2-204ENST00000467923 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.58■■■■■ 4.57
CDS2-204ENST00000467923 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.51■■■■■ 4.56
CDS2-204ENST00000467923 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
CDS2-204ENST00000467923 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.26■■■■■ 4.52
CDS2-204ENST00000467923 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.25■■■■■ 4.512e-8■■■■■ 37.6
CDS2-204ENST00000467923 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.25■■■■■ 4.51
CDS2-204ENST00000467923 SOGA1O94964 1423 aa43.14■■■■■ 4.5
CDS2-204ENST00000467923 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.09■■■■■ 4.49
CDS2-204ENST00000467923 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.08■■■■■ 4.49
CDS2-204ENST00000467923 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.08■■■■■ 4.49
CDS2-204ENST00000467923 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.08■■■■■ 4.49
CDS2-204ENST00000467923 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.01■■■■■ 4.48
CDS2-204ENST00000467923 FBLN2P98095 1184 aa43■■■■■ 4.47
CDS2-204ENST00000467923 ARHGEF11O15085 1522 aa42.99■■■■■ 4.47
CDS2-204ENST00000467923 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.97■■■■■ 4.47
CDS2-204ENST00000467923 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
CDS2-204ENST00000467923 CUX1P39880 1505 aa42.93■■■■■ 4.46
CDS2-204ENST00000467923 CHD1O14646 1710 aa42.91■■■■■ 4.46
CDS2-204ENST00000467923 WDR97A6NE52 1622 aa42.87■■■■■ 4.45
CDS2-204ENST00000467923 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.8■■■■■ 4.44
CDS2-204ENST00000467923 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.75■■■■■ 4.43
CDS2-204ENST00000467923 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.74■■■■■ 4.43
CDS2-204ENST00000467923 GRIN2BQ13224 1484 aa42.71■■■■■ 4.43
CDS2-204ENST00000467923 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.69■■■■■ 4.42
CDS2-204ENST00000467923 ARAP1Q96P48 1450 aa42.57■■■■■ 4.41
CDS2-204ENST00000467923 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.56■■■■■ 4.4
CDS2-204ENST00000467923 SYNJ2O15056 1496 aa42.55■■■■■ 4.4
CDS2-204ENST00000467923 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.53■■■■■ 4.4
CDS2-204ENST00000467923 SYNJ1O43426 1573 aa42.51■■■■■ 4.4
CDS2-204ENST00000467923 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.51■■■■■ 4.39
CDS2-204ENST00000467923 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.41■■■■■ 4.38
CDS2-204ENST00000467923 PBRM1Q86U86 1689 aa42.4■■■■■ 4.38
CDS2-204ENST00000467923 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.37■■■■■ 4.37
CDS2-204ENST00000467923 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.29■■■■■ 4.36
CDS2-204ENST00000467923 TOP2BQ02880 1626 aa42.28■■■■■ 4.36
CDS2-204ENST00000467923 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.24■■■■■ 4.35
CDS2-204ENST00000467923 GRIN2AQ12879 1464 aa42.12■■■■■ 4.33
CDS2-204ENST00000467923 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.05■■■■■ 4.32
CDS2-204ENST00000467923 ADAMTS12P58397 1594 aa42.03■■■■■ 4.32
CDS2-204ENST00000467923 NUP160Q12769 1436 aa42.01■■■■■ 4.32
CDS2-204ENST00000467923 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42■■■■■ 4.31
CDS2-204ENST00000467923 CEP170Q5SW79 1584 aa41.92■■■■■ 4.3
CDS2-204ENST00000467923 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.82■■■■■ 4.29
CDS2-204ENST00000467923 SHROOM2Q13796 1616 aa41.75■■■■■ 4.27
CDS2-204ENST00000467923 JPH4Q96JJ6 628 aa41.7■■■■■ 4.27
CDS2-204ENST00000467923 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
CDS2-204ENST00000467923 IGF1RP08069 1367 aa41.56■■■■■ 4.24
CDS2-204ENST00000467923 KIF27Q86VH2 1401 aa41.53■■■■■ 4.24
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