RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542820.5

ZNF664-212, Transcript of zinc finger protein 664, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ZNF664, Length 802 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF664-212ENST00000542820 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.05■■■■■ 6.24
ZNF664-212ENST00000542820 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.15■■■■■ 5.3
ZNF664-212ENST00000542820 ABCC9O60706 1549 aa47.1■■■■■ 5.13
ZNF664-212ENST00000542820 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.31■■■■■ 4.84
ZNF664-212ENST00000542820 NACADO15069 1562 aa45.27■■■■■ 4.84
ZNF664-212ENST00000542820 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.05■■■■■ 4.8
ZNF664-212ENST00000542820 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.01■■■■■ 4.8
ZNF664-212ENST00000542820 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.93■■■■■ 4.78
ZNF664-212ENST00000542820 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.79■■■■■ 4.76
ZNF664-212ENST00000542820 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.41■■■■■ 4.7
ZNF664-212ENST00000542820 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.05■■■■■ 4.64
ZNF664-212ENST00000542820 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.95■■■■■ 4.63
ZNF664-212ENST00000542820 SCRIBQ14160 1630 aa43.79■■■■■ 4.6
ZNF664-212ENST00000542820 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.55■■■■■ 4.56
ZNF664-212ENST00000542820 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.46■■■■■ 4.55
ZNF664-212ENST00000542820 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.82■■■■■ 4.45
ZNF664-212ENST00000542820 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.68■■■■■ 4.42
ZNF664-212ENST00000542820 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.36■■■■■ 4.37
ZNF664-212ENST00000542820 SMARCA4P51532 1647 aa41.96■■■■■ 4.31
ZNF664-212ENST00000542820 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.86■■■■■ 4.29
ZNF664-212ENST00000542820 NCAPD3P42695 1498 aa41.8■■■■■ 4.28
ZNF664-212ENST00000542820 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.78■■■■■ 4.28
ZNF664-212ENST00000542820 SMARCA2P51531 1590 aa41.68■■■■■ 4.26
ZNF664-212ENST00000542820 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.64■■■■■ 4.26
ZNF664-212ENST00000542820 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.63■■■■■ 4.26
ZNF664-212ENST00000542820 HMGXB3Q12766 1538 aa41.57■■■■■ 4.25
ZNF664-212ENST00000542820 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
ZNF664-212ENST00000542820 WIZO95785 1651 aa41.17■■■■■ 4.18
ZNF664-212ENST00000542820 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
ZNF664-212ENST00000542820 NESP48681 1621 aa40.77■■■■■ 4.12
ZNF664-212ENST00000542820 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
ZNF664-212ENST00000542820 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.68■■■■■ 4.1
ZNF664-212ENST00000542820 ERCC6Q03468 1493 aa40.53■■■■■ 4.08
ZNF664-212ENST00000542820 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.52■■■■■ 4.08
ZNF664-212ENST00000542820 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.34■■■■■ 4.05
ZNF664-212ENST00000542820 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.32■■■■■ 4.05
ZNF664-212ENST00000542820 CUX2O14529 1486 aa40.3■■■■■ 4.04
ZNF664-212ENST00000542820 CFTRP13569 1480 aa40.29■■■■■ 4.04
ZNF664-212ENST00000542820 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
ZNF664-212ENST00000542820 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.25■■■■■ 4.03
ZNF664-212ENST00000542820 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.02■■■■■ 4
ZNF664-212ENST00000542820 PRDM2Q13029 1718 aa40.02■■■■■ 4
ZNF664-212ENST00000542820 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.96■■■■□ 3.99
ZNF664-212ENST00000542820 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.96■■■■□ 3.99
ZNF664-212ENST00000542820 WDR62O43379 1518 aa39.9■■■■□ 3.98
ZNF664-212ENST00000542820 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
ZNF664-212ENST00000542820 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
ZNF664-212ENST00000542820 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.55■■■■□ 3.92
ZNF664-212ENST00000542820 TOPBP1Q92547 1522 aa39.4■■■■□ 3.9
ZNF664-212ENST00000542820 ABCC8Q09428 1581 aa39.38■■■■□ 3.89
ZNF664-212ENST00000542820 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.34■■■■□ 3.89
ZNF664-212ENST00000542820 IFT140Q96RY7 1462 aa39.17■■■■□ 3.86
ZNF664-212ENST00000542820 CUX1P39880 1505 aa39.07■■■■□ 3.84
ZNF664-212ENST00000542820 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.05■■■■□ 3.84
ZNF664-212ENST00000542820 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.04■■■■□ 3.84
ZNF664-212ENST00000542820 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.01■■■■□ 3.84
ZNF664-212ENST00000542820 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.92■■■■□ 3.82
ZNF664-212ENST00000542820 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.86■■■■□ 3.81
ZNF664-212ENST00000542820 SOGA1O94964 1423 aa38.85■■■■□ 3.81
ZNF664-212ENST00000542820 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.85■■■■□ 3.81
ZNF664-212ENST00000542820 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.74■■■■□ 3.798e-7■■■■■ 30.7
ZNF664-212ENST00000542820 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.73■■■■□ 3.79
ZNF664-212ENST00000542820 WDR97A6NE52 1622 aa38.72■■■■□ 3.79
ZNF664-212ENST00000542820 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.71■■■■□ 3.79
ZNF664-212ENST00000542820 TOP2BQ02880 1626 aa38.71■■■■□ 3.79
ZNF664-212ENST00000542820 SYNJ1O43426 1573 aa38.67■■■■□ 3.78
ZNF664-212ENST00000542820 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.63■■■■□ 3.77
ZNF664-212ENST00000542820 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.59■■■■□ 3.77
ZNF664-212ENST00000542820 OSCARQ8IYS5 282 aa38.53■■■■□ 3.76
ZNF664-212ENST00000542820 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.46■■■■□ 3.75
ZNF664-212ENST00000542820 GRIN2BQ13224 1484 aa38.42■■■■□ 3.74
ZNF664-212ENST00000542820 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.41■■■■□ 3.74
ZNF664-212ENST00000542820 CHD1O14646 1710 aa38.41■■■■□ 3.74
ZNF664-212ENST00000542820 PBRM1Q86U86 1689 aa38.38■■■■□ 3.73
ZNF664-212ENST00000542820 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.37■■■■□ 3.73
ZNF664-212ENST00000542820 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.36■■■■□ 3.73
ZNF664-212ENST00000542820 SYNJ2O15056 1496 aa38.21■■■■□ 3.71
ZNF664-212ENST00000542820 FBLN2P98095 1184 aa38.14■■■■□ 3.7
ZNF664-212ENST00000542820 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.11■■■■□ 3.69
ZNF664-212ENST00000542820 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.09■■■■□ 3.69
ZNF664-212ENST00000542820 ADAMTS12P58397 1594 aa38.06■■■■□ 3.68
ZNF664-212ENST00000542820 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.03■■■■□ 3.68
ZNF664-212ENST00000542820 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38■■■■□ 3.67
ZNF664-212ENST00000542820 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38■■■■□ 3.67
ZNF664-212ENST00000542820 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38■■■■□ 3.67
ZNF664-212ENST00000542820 ARHGEF11O15085 1522 aa37.97■■■■□ 3.67
ZNF664-212ENST00000542820 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.96■■■■□ 3.67
ZNF664-212ENST00000542820 GRIN2AQ12879 1464 aa37.94■■■■□ 3.66
ZNF664-212ENST00000542820 KIF27Q86VH2 1401 aa37.88■■■■□ 3.66
ZNF664-212ENST00000542820 NUP160Q12769 1436 aa37.84■■■■□ 3.65
ZNF664-212ENST00000542820 IGF1RP08069 1367 aa37.83■■■■□ 3.65
ZNF664-212ENST00000542820 CEP170Q5SW79 1584 aa37.79■■■■□ 3.64
ZNF664-212ENST00000542820 CUL7Q14999 1698 aa37.72■■■■□ 3.63
ZNF664-212ENST00000542820 TRIM41Q8WV44 630 aa37.68■■■■□ 3.62
ZNF664-212ENST00000542820 ARAP1Q96P48 1450 aa37.67■■■■□ 3.62
ZNF664-212ENST00000542820 SHROOM2Q13796 1616 aa37.61■■■■□ 3.61
ZNF664-212ENST00000542820 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.56■■■■□ 3.6
ZNF664-212ENST00000542820 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.55■■■■□ 3.6
ZNF664-212ENST00000542820 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.51■■■■□ 3.6
ZNF664-212ENST00000542820 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.46■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.4 ms