Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NKIRAS2Q9NYR9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NKIRAS2Q9NYR9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms