Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSG1Q9BU20 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RSG1Q9BU20 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms