Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPRD1AQ96P16 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPRD1AQ96P16 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms