Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPNS2Q96L46 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms