Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM12Q96EX1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM12Q96EX1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms