Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2H9

PELI3, E3 ubiquitin-protein ligase pellino homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PELI3Q8N2H9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PELI3Q8N2H9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PELI3Q8N2H9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms