Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMIGD1Q6UXZ0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms