Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4orf17Q53FE4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms