Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Q3C1V9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Q3C1V9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Q3C1V9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Q3C1V9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Q3C1V9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Q3C1V9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Q3C1V9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Q3C1V9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Q3C1V9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Q3C1V9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Q3C1V9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Q3C1V9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Q3C1V9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Q3C1V9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Q3C1V9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Q3C1V9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Q3C1V9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Q3C1V9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Q3C1V9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Q3C1V9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q3C1V9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q3C1V9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q3C1V9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q3C1V9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q3C1V9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q3C1V9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q3C1V9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q3C1V9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Q3C1V9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Q3C1V9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q3C1V9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Q3C1V9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q3C1V9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q3C1V9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q3C1V9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q3C1V9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q3C1V9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q3C1V9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q3C1V9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q3C1V9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q3C1V9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q3C1V9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q3C1V9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q3C1V9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q3C1V9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q3C1V9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q3C1V9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q3C1V9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Q3C1V9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Q3C1V9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q3C1V9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Q3C1V9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q3C1V9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q3C1V9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Q3C1V9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Q3C1V9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Q3C1V9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Q3C1V9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q3C1V9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q3C1V9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q3C1V9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q3C1V9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q3C1V9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q3C1V9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q3C1V9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q3C1V9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q3C1V9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q3C1V9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q3C1V9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q3C1V9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Q3C1V9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q3C1V9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q3C1V9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q3C1V9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q3C1V9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q3C1V9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Q3C1V9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q3C1V9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q3C1V9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q3C1V9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Q3C1V9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q3C1V9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q3C1V9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q3C1V9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q3C1V9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q3C1V9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q3C1V9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q3C1V9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q3C1V9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q3C1V9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q3C1V9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q3C1V9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q3C1V9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q3C1V9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q3C1V9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q3C1V9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Q3C1V9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Q3C1V9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q3C1V9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms