Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIGQ13278 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIGQ13278 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIGQ13278 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIGQ13278 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIGQ13278 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIGQ13278 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIGQ13278 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIGQ13278 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIGQ13278 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIGQ13278 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIGQ13278 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIGQ13278 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIGQ13278 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIGQ13278 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIGQ13278 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIGQ13278 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIGQ13278 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIGQ13278 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIGQ13278 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIGQ13278 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIGQ13278 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIGQ13278 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIGQ13278 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIGQ13278 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIGQ13278 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIGQ13278 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIGQ13278 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIGQ13278 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIGQ13278 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIGQ13278 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIGQ13278 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIGQ13278 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIGQ13278 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIGQ13278 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIGQ13278 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIGQ13278 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIGQ13278 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIGQ13278 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RIGQ13278 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIGQ13278 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RIGQ13278 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIGQ13278 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIGQ13278 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIGQ13278 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIGQ13278 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIGQ13278 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIGQ13278 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIGQ13278 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIGQ13278 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIGQ13278 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIGQ13278 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIGQ13278 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIGQ13278 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIGQ13278 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIGQ13278 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIGQ13278 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIGQ13278 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIGQ13278 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIGQ13278 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RIGQ13278 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RIGQ13278 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RIGQ13278 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIGQ13278 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIGQ13278 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIGQ13278 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIGQ13278 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIGQ13278 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIGQ13278 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIGQ13278 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIGQ13278 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIGQ13278 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIGQ13278 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIGQ13278 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIGQ13278 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIGQ13278 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIGQ13278 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIGQ13278 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIGQ13278 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIGQ13278 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIGQ13278 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RIGQ13278 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIGQ13278 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIGQ13278 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIGQ13278 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIGQ13278 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RIGQ13278 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIGQ13278 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIGQ13278 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIGQ13278 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIGQ13278 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIGQ13278 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIGQ13278 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIGQ13278 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIGQ13278 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIGQ13278 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIGQ13278 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIGQ13278 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIGQ13278 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIGQ13278 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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