Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SREBF2Q12772 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SREBF2Q12772 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SREBF2Q12772 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
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