Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL6Q02878 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL6Q02878 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms