Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PMS1P54277 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PMS1P54277 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PMS1P54277 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PMS1P54277 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PMS1P54277 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PMS1P54277 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PMS1P54277 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PMS1P54277 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PMS1P54277 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PMS1P54277 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PMS1P54277 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PMS1P54277 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PMS1P54277 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PMS1P54277 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PMS1P54277 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PMS1P54277 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PMS1P54277 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PMS1P54277 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PMS1P54277 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PMS1P54277 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PMS1P54277 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PMS1P54277 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PMS1P54277 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PMS1P54277 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PMS1P54277 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PMS1P54277 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PMS1P54277 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PMS1P54277 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PMS1P54277 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PMS1P54277 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PMS1P54277 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PMS1P54277 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PMS1P54277 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PMS1P54277 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PMS1P54277 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PMS1P54277 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PMS1P54277 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PMS1P54277 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PMS1P54277 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PMS1P54277 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PMS1P54277 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PMS1P54277 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PMS1P54277 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PMS1P54277 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PMS1P54277 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PMS1P54277 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PMS1P54277 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PMS1P54277 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PMS1P54277 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PMS1P54277 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PMS1P54277 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PMS1P54277 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PMS1P54277 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PMS1P54277 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PMS1P54277 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PMS1P54277 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PMS1P54277 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PMS1P54277 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMS1P54277 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMS1P54277 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMS1P54277 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMS1P54277 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMS1P54277 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMS1P54277 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMS1P54277 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMS1P54277 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMS1P54277 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMS1P54277 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMS1P54277 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PMS1P54277 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMS1P54277 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMS1P54277 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMS1P54277 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMS1P54277 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMS1P54277 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMS1P54277 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMS1P54277 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMS1P54277 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMS1P54277 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMS1P54277 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMS1P54277 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMS1P54277 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMS1P54277 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMS1P54277 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMS1P54277 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMS1P54277 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PMS1P54277 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMS1P54277 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMS1P54277 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMS1P54277 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMS1P54277 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMS1P54277 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMS1P54277 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMS1P54277 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMS1P54277 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMS1P54277 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMS1P54277 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMS1P54277 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMS1P54277 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms