Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 NOLC1-207ENST00000488254 2441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.153e-7■■■■■ 34.9
SUB1P53999 MDN1-204ENST00000487831 689 ntTSL 25.15□□□□□ -1.598e-9■■■■■ 34.9
SUB1P53999 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.68e-9■■■■■ 34.9
SUB1P53999 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.339e-9■■■■■ 34.9
SUB1P53999 TAF15-201ENST00000603067 580 ntTSL 55.9□□□□□ -1.469e-9■■■■■ 34.9
SUB1P53999 PAICS-207ENST00000512576 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.121e-6■■■■■ 34.9
SUB1P53999 PAICS-202ENST00000399688 3297 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.341e-6■■■■■ 34.9
SUB1P53999 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.561e-6■■■■■ 34.9
SUB1P53999 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.621e-6■■■■■ 34.9
SUB1P53999 PDCD2-201ENST00000167218 1118 ntTSL 520.94■□□□□ 0.945e-8■■■■■ 34.9
SUB1P53999 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.395e-7■■■■■ 34.8
SUB1P53999 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.451e-17■■■■■ 34.8
SUB1P53999 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.461e-17■■■■■ 34.8
SUB1P53999 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.591e-17■■■■■ 34.8
SUB1P53999 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.731e-17■■■■■ 34.8
SUB1P53999 STMN1-207ENST00000465604 2947 ntTSL 1 (best)2.42□□□□□ -2.021e-17■■■■■ 34.8
SUB1P53999 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.664e-7■■■■■ 34.8
SUB1P53999 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.74e-7■■■■■ 34.8
SUB1P53999 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.714e-7■■■■■ 34.8
SUB1P53999 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.714e-7■■■■■ 34.8
SUB1P53999 SMS-202ENST00000404933 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.894e-7■■■■■ 34.7
SUB1P53999 CTNNA1-236ENST00000522792 2044 ntTSL 212.26□□□□□ -0.453e-9■■■■■ 34.7
SUB1P53999 CTNNA1-243ENST00000540387 2684 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.243e-9■■■■■ 34.7
SUB1P53999 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.413e-9■■■■■ 34.7
SUB1P53999 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.493e-9■■■■■ 34.7
SUB1P53999 AC084033.3-203ENST00000546580 571 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -11e-7■■■■■ 34.7
SUB1P53999 AC084033.3-201ENST00000551421 451 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.231e-7■■■■■ 34.7
SUB1P53999 AC084033.3-202ENST00000547492 759 ntTSL 23.37□□□□□ -1.871e-7■■■■■ 34.7
SUB1P53999 EIF4A2-213ENST00000465792 734 ntTSL 22.48□□□□□ -2.011e-6■■■■■ 34.7
SUB1P53999 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.469e-7■■■■■ 34.7
SUB1P53999 PRPS2-202ENST00000380668 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.789e-7■■■■■ 34.7
SUB1P53999 PRPS2-204ENST00000461630 891 ntTSL 1 (best)5.8□□□□□ -1.489e-7■■■■■ 34.7
SUB1P53999 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.641e-7■■■■■ 34.6
SUB1P53999 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 34.6
SUB1P53999 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 34.6
SUB1P53999 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 34.6
SUB1P53999 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 34.6
SUB1P53999 CLTA-205ENST00000464497 1890 ntTSL 514.62□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 34.6
SUB1P53999 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.391e-7■■■■■ 34.6
SUB1P53999 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.461e-7■■■■■ 34.6
SUB1P53999 UNG-203ENST00000446767 2016 ntTSL 1 (best)15.76■□□□□ 0.117e-7■■■■■ 34.6
SUB1P53999 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 07e-7■■■■■ 34.6
SUB1P53999 UNG-204ENST00000539287 2234 ntTSL 513.84□□□□□ -0.197e-7■■■■■ 34.6
SUB1P53999 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.347e-7■■■■■ 34.6
SUB1P53999 FARSA-205ENST00000587488 514 ntTSL 310.56□□□□□ -0.722e-9■■■■■ 34.6
SUB1P53999 MAGEC2-201ENST00000247452 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.927e-7■■■■■ 34.6
SUB1P53999 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.137e-22■■■■■ 34.6
SUB1P53999 RPL17-218ENST00000583637 758 ntTSL 314.66□□□□□ -0.067e-22■■■■■ 34.6
SUB1P53999 RPL17-202ENST00000578532 684 ntTSL 214.66□□□□□ -0.067e-22■■■■■ 34.6
SUB1P53999 RPL17-209ENST00000580387 827 ntTSL 512.72□□□□□ -0.377e-22■■■■■ 34.6
SUB1P53999 RPL17-221ENST00000615760 650 ntTSL 312.61□□□□□ -0.397e-22■■■■■ 34.6
SUB1P53999 RPL17-223ENST00000618613 856 ntAPPRIS P1 TSL 312.34□□□□□ -0.437e-22■■■■■ 34.6
SUB1P53999 RPL17-C18orf32-201ENST00000332968 948 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.867e-22■■■■■ 34.6
SUB1P53999 RPL17-220ENST00000615479 586 ntTSL 59.07□□□□□ -0.967e-22■■■■■ 34.6
SUB1P53999 RPL17-207ENST00000580210 705 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.27e-22■■■■■ 34.6
SUB1P53999 RPL17-205ENST00000579408 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.257e-22■■■■■ 34.6
SUB1P53999 RPL17-222ENST00000617346 795 ntTSL 57.21□□□□□ -1.267e-22■■■■■ 34.6
SUB1P53999 RPL17-224ENST00000618619 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.267e-22■■■■■ 34.6
SUB1P53999 RPL17-212ENST00000581373 584 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.367e-22■■■■■ 34.6
SUB1P53999 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.457e-22■■■■■ 34.6
SUB1P53999 RPL17-217ENST00000583036 576 ntTSL 35.52□□□□□ -1.537e-22■■■■■ 34.6
SUB1P53999 CFDP1-201ENST00000283882 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.823e-7■■■■■ 34.5
SUB1P53999 TMEM9-210ENST00000495205 971 ntTSL 510.04□□□□□ -0.81e-8■■■■■ 34.4
SUB1P53999 PRMT1-216ENST00000530361 866 ntTSL 313.98□□□□□ -0.177e-10■■■■■ 34.3
SUB1P53999 PRMT1-209ENST00000527866 968 ntTSL 212.21□□□□□ -0.457e-10■■■■■ 34.3
SUB1P53999 TPP1-201ENST00000299427 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.131e-6■■■■■ 34.3
SUB1P53999 TPP1-215ENST00000533371 3536 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 34.3
SUB1P53999 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.251e-13■■■■■ 34.3
SUB1P53999 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.375e-19■■■■■ 34.3
SUB1P53999 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 34.3
SUB1P53999 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.524e-7■■■■■ 34.3
SUB1P53999 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.397e-7■■■■■ 34.3
SUB1P53999 REEP5-204ENST00000497856 1779 ntTSL 1 (best)11.37□□□□□ -0.597e-7■■■■■ 34.3
SUB1P53999 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.877e-7■■■■■ 34.3
SUB1P53999 REEP5-206ENST00000511865 1187 ntTSL 29.29□□□□□ -0.927e-7■■■■■ 34.3
SUB1P53999 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 34.3
SUB1P53999 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 34.3
SUB1P53999 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 34.3
SUB1P53999 ACSL1-204ENST00000504342 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 34.3
SUB1P53999 ACSL1-203ENST00000503407 2409 ntTSL 28.82□□□□□ -12e-6■■■■■ 34.3
SUB1P53999 ACSL1-207ENST00000506733 2646 ntTSL 28.66□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 34.3
SUB1P53999 MND1-206ENST00000622785 830 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.112e-11■■■■■ 34.3
SUB1P53999 MND1-201ENST00000240488 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.182e-11■■■■■ 34.3
SUB1P53999 ACSL1-212ENST00000622937 4103 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.262e-6■■■■■ 34.3
SUB1P53999 ACSL1-211ENST00000515030 3948 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.322e-6■■■■■ 34.3
SUB1P53999 ACSL1-209ENST00000513001 2796 ntTSL 23.62□□□□□ -1.832e-6■■■■■ 34.3
SUB1P53999 EIF4A2-201ENST00000323963 1919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.122e-7■■■■■ 34.3
SUB1P53999 EIF4A2-203ENST00000426808 1751 ntTSL 1 (best)6.02□□□□□ -1.452e-7■■■■■ 34.3
SUB1P53999 EIF4A2-207ENST00000443963 1729 ntTSL 1 (best)5.4□□□□□ -1.542e-7■■■■■ 34.3
SUB1P53999 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.562e-7■■■■■ 34.3
SUB1P53999 EIF4A2-202ENST00000425053 1977 ntTSL 54.67□□□□□ -1.662e-7■■■■■ 34.3
SUB1P53999 EIF4A2-219ENST00000485101 5327 ntTSL 53.54□□□□□ -1.842e-7■■■■■ 34.3
SUB1P53999 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.575e-7■■■■■ 34.3
SUB1P53999 SPCS1-206ENST00000619898 4254 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 34.3
SUB1P53999 SPCS1-204ENST00000474945 981 ntTSL 210.2□□□□□ -0.785e-7■■■■■ 34.3
SUB1P53999 SPCS1-205ENST00000602728 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.245e-7■■■■■ 34.3
SUB1P53999 SPCS1-202ENST00000423431 822 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.465e-7■■■■■ 34.3
SUB1P53999 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.669e-9■■■■■ 34.3
SUB1P53999 PDHA1-206ENST00000422285 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.769e-9■■■■■ 34.3
SUB1P53999 PDHA1-213ENST00000545074 3391 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.779e-9■■■■■ 34.3
Retrieved 100 of 11,644 protein–RNA pairs in 233.3 ms