RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423431.5

SPCS1-202, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SPCS1, Length 822 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-202ENST00000423431 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
SPCS1-202ENST00000423431 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.08■■■□□ 2.25
SPCS1-202ENST00000423431 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
SPCS1-202ENST00000423431 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
SPCS1-202ENST00000423431 FOXD1Q16676 465 aa24.4■■□□□ 1.5
SPCS1-202ENST00000423431 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.2■■□□□ 1.3
SPCS1-202ENST00000423431 MSH5O43196 834 aa22.81■■□□□ 1.24
SPCS1-202ENST00000423431 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.8■■□□□ 1.24
SPCS1-202ENST00000423431 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SPCS1-202ENST00000423431 ADRA2BP18089 450 aa22.72■■□□□ 1.23
SPCS1-202ENST00000423431 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.64■■□□□ 1.21
SPCS1-202ENST00000423431 POTEDQ86YR6 584 aa22.38■■□□□ 1.17
SPCS1-202ENST00000423431 ABCC9O60706 1549 aa21.6■■□□□ 1.05
SPCS1-202ENST00000423431 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.98■□□□□ 0.95
SPCS1-202ENST00000423431 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
SPCS1-202ENST00000423431 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.74■□□□□ 0.91
SPCS1-202ENST00000423431 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
SPCS1-202ENST00000423431 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.57■□□□□ 0.88
SPCS1-202ENST00000423431 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.35■□□□□ 0.85
SPCS1-202ENST00000423431 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa20.08■□□□□ 0.8
SPCS1-202ENST00000423431 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
SPCS1-202ENST00000423431 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa19.97■□□□□ 0.79
SPCS1-202ENST00000423431 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
SPCS1-202ENST00000423431 DCAF8L1A6NGE4 600 aa19.88■□□□□ 0.77
SPCS1-202ENST00000423431 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa19.83■□□□□ 0.77
SPCS1-202ENST00000423431 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
SPCS1-202ENST00000423431 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.78■□□□□ 0.76
SPCS1-202ENST00000423431 NACADO15069 1562 aa19.7■□□□□ 0.74
SPCS1-202ENST00000423431 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
SPCS1-202ENST00000423431 UNC13AQ9UPW8 1703 aa19.53■□□□□ 0.72
SPCS1-202ENST00000423431 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
SPCS1-202ENST00000423431 CECR2Q9BXF3 1484 aa19.5■□□□□ 0.71
SPCS1-202ENST00000423431 BICRAQ9NZM4 1560 aa19.49■□□□□ 0.71
SPCS1-202ENST00000423431 RNF39Q9H2S5 420 aa19.48■□□□□ 0.71
SPCS1-202ENST00000423431 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.38■□□□□ 0.69
SPCS1-202ENST00000423431 NPM3O75607 178 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
SPCS1-202ENST00000423431 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
SPCS1-202ENST00000423431 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
SPCS1-202ENST00000423431 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.07■□□□□ 0.64
SPCS1-202ENST00000423431 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa19.06■□□□□ 0.64
SPCS1-202ENST00000423431 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP19■□□□□ 0.63
SPCS1-202ENST00000423431 KCNA4P22459 653 aa18.87■□□□□ 0.61
SPCS1-202ENST00000423431 SCRIBQ14160 1630 aa18.87■□□□□ 0.61
SPCS1-202ENST00000423431 CUX2O14529 1486 aa18.84■□□□□ 0.61
SPCS1-202ENST00000423431 TRIM41Q8WV44 630 aa18.81■□□□□ 0.6
SPCS1-202ENST00000423431 ERCC6Q03468 1493 aa18.72■□□□□ 0.59
SPCS1-202ENST00000423431 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
SPCS1-202ENST00000423431 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
SPCS1-202ENST00000423431 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.55■□□□□ 0.56
SPCS1-202ENST00000423431 SLC4A2P04920 1241 aa18.43■□□□□ 0.54
SPCS1-202ENST00000423431 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
SPCS1-202ENST00000423431 CAPN15O75808 1086 aa18.33■□□□□ 0.52
SPCS1-202ENST00000423431 NESP48681 1621 aa18.3■□□□□ 0.52
SPCS1-202ENST00000423431 DSG3P32926 999 aa18.24■□□□□ 0.51
SPCS1-202ENST00000423431 NCAPD3P42695 1498 aa18.22■□□□□ 0.51
SPCS1-202ENST00000423431 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SPCS1-202ENST00000423431 SMARCA2P51531 1590 aa18.13■□□□□ 0.49
SPCS1-202ENST00000423431 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa18.09■□□□□ 0.49
SPCS1-202ENST00000423431 APLP2Q06481 763 aa18.05■□□□□ 0.48
SPCS1-202ENST00000423431 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
SPCS1-202ENST00000423431 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
SPCS1-202ENST00000423431 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SPCS1-202ENST00000423431 HMGXB3Q12766 1538 aa17.98■□□□□ 0.47
SPCS1-202ENST00000423431 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
SPCS1-202ENST00000423431 OSCARQ8IYS5 282 aa17.96■□□□□ 0.47
SPCS1-202ENST00000423431 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa17.94■□□□□ 0.46
SPCS1-202ENST00000423431 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.93■□□□□ 0.46
SPCS1-202ENST00000423431 PDS5BQ9NTI5 1447 aa17.93■□□□□ 0.46
SPCS1-202ENST00000423431 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
SPCS1-202ENST00000423431 ABCB7O75027 752 aa17.91■□□□□ 0.46
SPCS1-202ENST00000423431 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
SPCS1-202ENST00000423431 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
SPCS1-202ENST00000423431 SMARCA4P51532 1647 aa17.83■□□□□ 0.44
SPCS1-202ENST00000423431 MRC2Q9UBG0 1479 aa17.82■□□□□ 0.44
SPCS1-202ENST00000423431 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
SPCS1-202ENST00000423431 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
SPCS1-202ENST00000423431 WDR62O43379 1518 aa17.74■□□□□ 0.43
SPCS1-202ENST00000423431 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa17.73■□□□□ 0.43
SPCS1-202ENST00000423431 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa17.73■□□□□ 0.43
SPCS1-202ENST00000423431 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa17.73■□□□□ 0.43
SPCS1-202ENST00000423431 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.69■□□□□ 0.42
SPCS1-202ENST00000423431 CYB5RLQ6IPT4 315 aa17.66■□□□□ 0.42
SPCS1-202ENST00000423431 FOXD4L1Q9NU39 408 aa17.6■□□□□ 0.41
SPCS1-202ENST00000423431 ARHGEF11O15085 1522 aa17.6■□□□□ 0.41
SPCS1-202ENST00000423431 CEP164Q9UPV0 1460 aa17.59■□□□□ 0.41
SPCS1-202ENST00000423431 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.57■□□□□ 0.4
SPCS1-202ENST00000423431 POLA2Q14181 598 aa17.53■□□□□ 0.4
SPCS1-202ENST00000423431 POTEHQ6S545 545 aa17.52■□□□□ 0.4
SPCS1-202ENST00000423431 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.5■□□□□ 0.39
SPCS1-202ENST00000423431 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.48■□□□□ 0.39
SPCS1-202ENST00000423431 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
SPCS1-202ENST00000423431 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
SPCS1-202ENST00000423431 ARAP1Q96P48 1450 aa17.37■□□□□ 0.37
SPCS1-202ENST00000423431 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
SPCS1-202ENST00000423431 ZBTB22O15209 634 aa17.35■□□□□ 0.37
SPCS1-202ENST00000423431 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
SPCS1-202ENST00000423431 FBLN2P98095 1184 aa17.3■□□□□ 0.36
SPCS1-202ENST00000423431 CFTRP13569 1480 aa17.26■□□□□ 0.35
SPCS1-202ENST00000423431 IFT140Q96RY7 1462 aa17.25■□□□□ 0.35
SPCS1-202ENST00000423431 WIZO95785 1651 aa17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.3 ms