Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSC2P49815 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSC2P49815 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSC2P49815 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSC2P49815 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSC2P49815 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSC2P49815 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSC2P49815 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSC2P49815 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSC2P49815 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TSC2P49815 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSC2P49815 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TSC2P49815 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TSC2P49815 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSC2P49815 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSC2P49815 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSC2P49815 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TSC2P49815 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSC2P49815 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSC2P49815 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSC2P49815 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSC2P49815 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSC2P49815 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSC2P49815 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSC2P49815 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSC2P49815 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSC2P49815 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TSC2P49815 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSC2P49815 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSC2P49815 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSC2P49815 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSC2P49815 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSC2P49815 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSC2P49815 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSC2P49815 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSC2P49815 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSC2P49815 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSC2P49815 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TSC2P49815 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSC2P49815 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TSC2P49815 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSC2P49815 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSC2P49815 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSC2P49815 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSC2P49815 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSC2P49815 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSC2P49815 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSC2P49815 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSC2P49815 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSC2P49815 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSC2P49815 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSC2P49815 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSC2P49815 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSC2P49815 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TSC2P49815 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSC2P49815 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSC2P49815 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSC2P49815 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSC2P49815 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSC2P49815 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TSC2P49815 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSC2P49815 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSC2P49815 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TSC2P49815 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TSC2P49815 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSC2P49815 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSC2P49815 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSC2P49815 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSC2P49815 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSC2P49815 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSC2P49815 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSC2P49815 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSC2P49815 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSC2P49815 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSC2P49815 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSC2P49815 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSC2P49815 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TSC2P49815 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSC2P49815 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSC2P49815 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSC2P49815 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSC2P49815 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSC2P49815 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSC2P49815 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSC2P49815 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSC2P49815 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSC2P49815 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSC2P49815 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSC2P49815 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSC2P49815 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSC2P49815 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSC2P49815 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSC2P49815 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSC2P49815 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSC2P49815 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSC2P49815 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSC2P49815 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSC2P49815 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSC2P49815 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSC2P49815 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms