Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
REG1BP48304 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
REG1BP48304 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
REG1BP48304 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
REG1BP48304 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
REG1BP48304 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
REG1BP48304 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
REG1BP48304 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
REG1BP48304 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
REG1BP48304 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
REG1BP48304 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
REG1BP48304 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
REG1BP48304 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
REG1BP48304 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
REG1BP48304 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
REG1BP48304 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
REG1BP48304 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
REG1BP48304 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
REG1BP48304 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
REG1BP48304 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
REG1BP48304 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
REG1BP48304 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
REG1BP48304 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
REG1BP48304 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
REG1BP48304 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
REG1BP48304 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
REG1BP48304 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
REG1BP48304 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
REG1BP48304 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
REG1BP48304 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
REG1BP48304 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
REG1BP48304 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
REG1BP48304 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
REG1BP48304 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
REG1BP48304 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
REG1BP48304 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
REG1BP48304 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
REG1BP48304 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
REG1BP48304 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
REG1BP48304 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
REG1BP48304 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
REG1BP48304 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
REG1BP48304 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
REG1BP48304 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
REG1BP48304 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
REG1BP48304 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
REG1BP48304 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
REG1BP48304 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
REG1BP48304 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
REG1BP48304 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
REG1BP48304 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
REG1BP48304 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
REG1BP48304 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
REG1BP48304 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
REG1BP48304 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
REG1BP48304 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
REG1BP48304 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
REG1BP48304 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
REG1BP48304 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
REG1BP48304 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
REG1BP48304 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
REG1BP48304 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
REG1BP48304 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
REG1BP48304 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
REG1BP48304 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
REG1BP48304 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
REG1BP48304 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
REG1BP48304 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
REG1BP48304 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
REG1BP48304 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
REG1BP48304 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
REG1BP48304 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
REG1BP48304 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
REG1BP48304 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
REG1BP48304 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
REG1BP48304 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
REG1BP48304 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
REG1BP48304 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
REG1BP48304 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
REG1BP48304 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
REG1BP48304 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
REG1BP48304 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
REG1BP48304 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
REG1BP48304 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
REG1BP48304 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
REG1BP48304 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
REG1BP48304 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
REG1BP48304 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
REG1BP48304 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
REG1BP48304 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
REG1BP48304 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
REG1BP48304 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
REG1BP48304 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
REG1BP48304 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
REG1BP48304 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
REG1BP48304 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
REG1BP48304 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
REG1BP48304 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
REG1BP48304 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
REG1BP48304 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms