Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL3P36405 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL3P36405 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARL3P36405 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL3P36405 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL3P36405 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL3P36405 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL3P36405 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL3P36405 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL3P36405 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL3P36405 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL3P36405 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL3P36405 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL3P36405 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL3P36405 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARL3P36405 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARL3P36405 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARL3P36405 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARL3P36405 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARL3P36405 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARL3P36405 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARL3P36405 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARL3P36405 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARL3P36405 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARL3P36405 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARL3P36405 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARL3P36405 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ARL3P36405 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARL3P36405 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ARL3P36405 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ARL3P36405 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL3P36405 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL3P36405 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL3P36405 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL3P36405 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL3P36405 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL3P36405 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL3P36405 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL3P36405 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL3P36405 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL3P36405 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL3P36405 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL3P36405 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL3P36405 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL3P36405 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL3P36405 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL3P36405 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL3P36405 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL3P36405 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL3P36405 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL3P36405 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL3P36405 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL3P36405 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL3P36405 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL3P36405 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL3P36405 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL3P36405 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL3P36405 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL3P36405 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL3P36405 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL3P36405 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL3P36405 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL3P36405 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL3P36405 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL3P36405 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL3P36405 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL3P36405 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL3P36405 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL3P36405 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL3P36405 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL3P36405 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL3P36405 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL3P36405 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL3P36405 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL3P36405 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL3P36405 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL3P36405 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL3P36405 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL3P36405 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL3P36405 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL3P36405 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL3P36405 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL3P36405 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL3P36405 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL3P36405 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL3P36405 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL3P36405 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL3P36405 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL3P36405 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL3P36405 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL3P36405 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL3P36405 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL3P36405 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL3P36405 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL3P36405 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL3P36405 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL3P36405 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL3P36405 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL3P36405 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL3P36405 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms