Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 37.5
DKC1O60832 LRP3-202ENST00000590275 1078 ntTSL 223.87■■□□□ 1.413e-8■■■■■ 37.5
DKC1O60832 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.733e-8■■■■■ 37.5
DKC1O60832 LRP3-204ENST00000592484 575 ntTSL 417.82■□□□□ 0.443e-8■■■■■ 37.5
DKC1O60832 AGAP1-206ENST00000418654 826 ntTSL 39.95□□□□□ -0.822e-7■■■■■ 37.4
DKC1O60832 SNORA71C-201ENST00000364642 134 ntBASIC10.55□□□□□ -0.721e-323■■■■■ 37.4
DKC1O60832 PNPT1-205ENST00000447944 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.677e-10■■■■■ 37.4
DKC1O60832 PNPT1-201ENST00000260604 3596 ntTSL 59.42□□□□□ -0.97e-10■■■■■ 37.4
DKC1O60832 PNPT1-202ENST00000415374 3308 ntTSL 59.06□□□□□ -0.967e-10■■■■■ 37.4
DKC1O60832 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.683e-6■■■■■ 37.4
DKC1O60832 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.093e-6■■■■■ 37.4
DKC1O60832 HDGFL2-207ENST00000615225 3100 ntTSL 518.72■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 37.4
DKC1O60832 HDGFL2-202ENST00000589486 805 ntTSL 514.5□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 37.4
DKC1O60832 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.73□□□□□ -1.971e-323■■■■■ 37.3
DKC1O60832 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.062e-6■■■■■ 37.3
DKC1O60832 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 37.3
DKC1O60832 NGEF-205ENST00000416114 667 ntTSL 312.93□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 37.3
DKC1O60832 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.12e-8■■■■■ 37.2
DKC1O60832 HSD17B12-212ENST00000636722 540 ntTSL 422.34■■□□□ 1.172e-8■■■■■ 37.2
DKC1O60832 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.172e-8■■■■■ 37.2
DKC1O60832 HSD17B12-211ENST00000636007 563 ntTSL 420.21■□□□□ 0.832e-8■■■■■ 37.2
DKC1O60832 HSD17B12-206ENST00000531185 611 ntTSL 418.56■□□□□ 0.562e-8■■■■■ 37.2
DKC1O60832 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.522e-8■■■■■ 37.2
DKC1O60832 HSD17B12-205ENST00000527433 559 ntTSL 416.06■□□□□ 0.162e-8■■■■■ 37.2
DKC1O60832 AC068205.2-203ENST00000529261 748 ntTSL 310.76□□□□□ -0.692e-8■■■■■ 37.2
DKC1O60832 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.122e-8■■■■■ 37.2
DKC1O60832 HSD17B12-214ENST00000638034 546 ntTSL 55.21□□□□□ -1.582e-8■■■■■ 37.2
DKC1O60832 SH3PXD2A-204ENST00000420222 3251 ntTSL 215.43■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 37.2
DKC1O60832 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.28□□□□□ -2.361e-323■■■■■ 37.2
DKC1O60832 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.761e-6■■■■■ 37.2
DKC1O60832 PTPRK-219ENST00000531050 2515 ntTSL 1 (best)8.29□□□□□ -1.087e-7■■■■■ 37.2
DKC1O60832 ADARB1-207ENST00000460734 2523 ntTSL 1 (best)26.91■■□□□ 1.97e-8■■■■■ 37.2
DKC1O60832 ADARB1-206ENST00000449478 704 ntTSL 517.89■□□□□ 0.457e-8■■■■■ 37.2
DKC1O60832 ADARB1-208ENST00000462214 587 ntTSL 39.18□□□□□ -0.947e-8■■■■■ 37.2
DKC1O60832 ADARB1-209ENST00000464215 389 ntTSL 38.1□□□□□ -1.117e-8■■■■■ 37.2
DKC1O60832 NCBP3-207ENST00000577169 645 ntTSL 1 (best)17.61■□□□□ 0.417e-13■■■■■ 37.1
DKC1O60832 NCBP3-204ENST00000574911 2701 ntTSL 1 (best)9.57□□□□□ -0.887e-13■■■■■ 37.1
DKC1O60832 NCBP3-205ENST00000575815 4096 ntTSL 29.28□□□□□ -0.927e-13■■■■■ 37.1
DKC1O60832 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.017e-13■■■■■ 37.1
DKC1O60832 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.32□□□□□ -1.561e-26■■■■■ 37.1
DKC1O60832 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 37
DKC1O60832 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 37
DKC1O60832 LRRC37B-206ENST00000578674 2807 ntTSL 1 (best)7.95□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 37
DKC1O60832 LRRC37B-217ENST00000583204 2452 ntTSL 1 (best)7.8□□□□□ -1.162e-7■■■■■ 37
DKC1O60832 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.182e-7■■■■■ 37
DKC1O60832 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.192e-7■■■■■ 37
DKC1O60832 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.192e-7■■■■■ 37
DKC1O60832 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.312e-7■■■■■ 37
DKC1O60832 LRRC37B-214ENST00000581786 792 ntTSL 56.63□□□□□ -1.352e-7■■■■■ 37
DKC1O60832 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.362e-7■■■■■ 37
DKC1O60832 LRRC37B-211ENST00000580871 673 ntTSL 36.47□□□□□ -1.372e-7■■■■■ 37
DKC1O60832 LRRC37B-216ENST00000582815 582 ntTSL 55.09□□□□□ -1.592e-7■■■■■ 37
DKC1O60832 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.041e-11■■■■■ 36.8
DKC1O60832 SEPT9-219ENST00000588575 559 ntTSL 422.93■■□□□ 1.265e-7■■■■■ 36.8
DKC1O60832 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.455e-7■■■■■ 36.8
DKC1O60832 FOXRED1-203ENST00000525083 1228 ntTSL 219.6■□□□□ 0.734e-12■■■■■ 36.8
DKC1O60832 FOXRED1-207ENST00000527004 1760 ntTSL 517.43■□□□□ 0.384e-12■■■■■ 36.8
DKC1O60832 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.364e-12■■■■■ 36.8
DKC1O60832 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.34e-12■■■■■ 36.8
DKC1O60832 FOXRED1-204ENST00000525770 1427 ntTSL 216.36■□□□□ 0.214e-12■■■■■ 36.8
DKC1O60832 FOXRED1-218ENST00000534315 2210 ntTSL 1 (best)14.81□□□□□ -0.044e-12■■■■■ 36.8
DKC1O60832 FOXRED1-217ENST00000534011 1955 ntTSL 214.65□□□□□ -0.064e-12■■■■■ 36.8
DKC1O60832 FOXRED1-216ENST00000533839 559 ntTSL 410.88□□□□□ -0.674e-12■■■■■ 36.8
DKC1O60832 FOXRED1-210ENST00000530642 3045 ntTSL 29.03□□□□□ -0.964e-12■■■■■ 36.8
DKC1O60832 SHANK2-208ENST00000426687 460 ntTSL 59.66□□□□□ -0.869e-7■■■■■ 36.7
DKC1O60832 SYNJ2-206ENST00000485863 810 ntTSL 320.85■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 36.7
DKC1O60832 COL18A1-201ENST00000342220 3386 ntTSL 214.12□□□□□ -0.156e-7■■■■■ 36.6
DKC1O60832 RALY-205ENST00000442805 871 ntTSL 528.54■■■□□ 2.164e-10■■■■■ 36.6
DKC1O60832 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.124e-10■■■■■ 36.6
DKC1O60832 RALY-206ENST00000448364 1204 ntTSL 227.27■■□□□ 1.964e-10■■■■■ 36.6
DKC1O60832 RALY-204ENST00000413297 766 ntTSL 523.37■■□□□ 1.334e-10■■■■■ 36.6
DKC1O60832 RALY-202ENST00000333552 786 ntTSL 323.35■■□□□ 1.334e-10■■■■■ 36.6
DKC1O60832 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.854e-10■■■■■ 36.6
DKC1O60832 RALY-210ENST00000493399 513 ntTSL 516.28■□□□□ 0.24e-10■■■■■ 36.6
DKC1O60832 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 36.5
DKC1O60832 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 36.5
DKC1O60832 HNF1A-206ENST00000538646 1649 ntTSL 1 (best)24.31■■□□□ 1.484e-8■■■■■ 36.5
DKC1O60832 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.434e-8■■■■■ 36.5
DKC1O60832 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.44e-8■■■■■ 36.5
DKC1O60832 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.394e-8■■■■■ 36.5
DKC1O60832 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.314e-8■■■■■ 36.5
DKC1O60832 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.274e-8■■■■■ 36.5
DKC1O60832 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.214e-8■■■■■ 36.5
DKC1O60832 HNF1A-209ENST00000541924 1594 ntTSL 1 (best)22.13■■□□□ 1.134e-8■■■■■ 36.5
DKC1O60832 DONSON-211ENST00000457359 2273 ntTSL 522.04■■□□□ 1.124e-8■■■■■ 36.5
DKC1O60832 TXNDC16-204ENST00000557374 542 ntTSL 421.95■■□□□ 1.14e-8■■■■■ 36.5
DKC1O60832 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 11e-7■■■■■ 36.5
DKC1O60832 CTNS-204ENST00000452111 617 ntTSL 320.11■□□□□ 0.814e-15■■■■■ 36.5
DKC1O60832 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.784e-15■■■■■ 36.5
DKC1O60832 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.754e-8■■■■■ 36.5
DKC1O60832 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.725e-6■■■■■ 36.5
DKC1O60832 CTNS-207ENST00000495445 536 ntTSL 219.4■□□□□ 0.74e-15■■■■■ 36.5
DKC1O60832 NUMA1-213ENST00000537217 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)19.03■□□□□ 0.644e-8■■■■■ 36.5
DKC1O60832 PPFIBP2-223ENST00000532926 1597 ntTSL 218.93■□□□□ 0.624e-8■■■■■ 36.5
DKC1O60832 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.551e-7■■■■■ 36.5
DKC1O60832 HNF1A-213ENST00000544574 725 ntTSL 1 (best)18.45■□□□□ 0.544e-8■■■■■ 36.5
DKC1O60832 HNF1A-205ENST00000538626 582 ntTSL 1 (best)18.45■□□□□ 0.544e-8■■■■■ 36.5
DKC1O60832 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.514e-8■■■■■ 36.5
DKC1O60832 TXNDC16-202ENST00000554399 504 ntTSL 418.1■□□□□ 0.494e-8■■■■■ 36.5
DKC1O60832 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.451e-7■■■■■ 36.5
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