RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442805.1

RALY-205, Transcript of RALY heterogeneous nuclear ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene RALY, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALY-205ENST00000442805 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.81■■■■■ 7.97
RALY-205ENST00000442805 ABCC9O60706 1549 aa58.85■■■■■ 7.01
RALY-205ENST00000442805 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.41■■■■■ 6.94
RALY-205ENST00000442805 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.82■■■■■ 6.53
RALY-205ENST00000442805 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.61■■■■■ 6.49
RALY-205ENST00000442805 NACADO15069 1562 aa55.31■■■■■ 6.44
RALY-205ENST00000442805 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.91■■■■■ 6.38
RALY-205ENST00000442805 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.7■■■■■ 6.35
RALY-205ENST00000442805 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.62■■■■■ 6.33
RALY-205ENST00000442805 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.36■■■■■ 6.29
RALY-205ENST00000442805 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.21■■■■■ 6.27
RALY-205ENST00000442805 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.6■■■■■ 6.17
RALY-205ENST00000442805 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.49■■■■■ 6.15
RALY-205ENST00000442805 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.4■■■■■ 6.14
RALY-205ENST00000442805 SCRIBQ14160 1630 aa53.18■■■■■ 6.1
RALY-205ENST00000442805 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.15■■■■■ 6.1
RALY-205ENST00000442805 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.07■■■■■ 6.09
RALY-205ENST00000442805 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.91■■■■■ 6.06
RALY-205ENST00000442805 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.42■■■■■ 5.82
RALY-205ENST00000442805 NCAPD3P42695 1498 aa51.04■■■■■ 5.76
RALY-205ENST00000442805 CUX2O14529 1486 aa50.91■■■■■ 5.74
RALY-205ENST00000442805 ERCC6Q03468 1493 aa50.85■■■■■ 5.73
RALY-205ENST00000442805 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.83■■■■■ 5.73
RALY-205ENST00000442805 SMARCA4P51532 1647 aa50.68■■■■■ 5.7
RALY-205ENST00000442805 SMARCA2P51531 1590 aa50.68■■■■■ 5.7
RALY-205ENST00000442805 HMGXB3Q12766 1538 aa50.64■■■■■ 5.7
RALY-205ENST00000442805 NESP48681 1621 aa50.42■■■■■ 5.66
RALY-205ENST00000442805 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.34■■■■■ 5.65
RALY-205ENST00000442805 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.32■■■■■ 5.65
RALY-205ENST00000442805 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.17■■■■■ 5.62
RALY-205ENST00000442805 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.02■■■■■ 5.6
RALY-205ENST00000442805 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50■■■■■ 5.59
RALY-205ENST00000442805 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.93■■■■■ 5.58
RALY-205ENST00000442805 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.8■■■■■ 5.56
RALY-205ENST00000442805 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.71■■■■■ 5.55
RALY-205ENST00000442805 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.47■■■■■ 5.51
RALY-205ENST00000442805 WIZO95785 1651 aa49.34■■■■■ 5.49
RALY-205ENST00000442805 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.32■■■■■ 5.49
RALY-205ENST00000442805 WDR62O43379 1518 aa49.22■■■■■ 5.47
RALY-205ENST00000442805 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.03■■■■■ 5.44
RALY-205ENST00000442805 TRIM41Q8WV44 630 aa48.99■■■■■ 5.43
RALY-205ENST00000442805 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.93■■■■■ 5.42
RALY-205ENST00000442805 CFTRP13569 1480 aa48.8■■■■■ 5.4
RALY-205ENST00000442805 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.7■■■■■ 5.39
RALY-205ENST00000442805 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.66■■■■■ 5.38
RALY-205ENST00000442805 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.55■■■■■ 5.36
RALY-205ENST00000442805 OSCARQ8IYS5 282 aa48.5■■■■■ 5.35
RALY-205ENST00000442805 PRDM2Q13029 1718 aa48.38■■■■■ 5.33
RALY-205ENST00000442805 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.1■■■■■ 5.29
RALY-205ENST00000442805 IFT140Q96RY7 1462 aa48.06■■■■■ 5.28
RALY-205ENST00000442805 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.03■■■■■ 5.28
RALY-205ENST00000442805 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.96■■■■■ 5.27
RALY-205ENST00000442805 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.96■■■■■ 5.27
RALY-205ENST00000442805 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.96■■■■■ 5.27
RALY-205ENST00000442805 TOPBP1Q92547 1522 aa47.95■■■■■ 5.27
RALY-205ENST00000442805 ABCC8Q09428 1581 aa47.81■■■■■ 5.24
RALY-205ENST00000442805 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.77■■■■■ 5.24
RALY-205ENST00000442805 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.75■■■■■ 5.23
RALY-205ENST00000442805 ARHGEF11O15085 1522 aa47.74■■■■■ 5.23
RALY-205ENST00000442805 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.57■■■■■ 5.21
RALY-205ENST00000442805 CHD1O14646 1710 aa47.55■■■■■ 5.2
RALY-205ENST00000442805 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.53■■■■■ 5.22e-8■■■■■ 41.8
RALY-205ENST00000442805 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.42■■■■■ 5.18
RALY-205ENST00000442805 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.41■■■■■ 5.18
RALY-205ENST00000442805 FBLN2P98095 1184 aa47.32■■■■■ 5.17
RALY-205ENST00000442805 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.27■■■■■ 5.16
RALY-205ENST00000442805 ARAP1Q96P48 1450 aa47.24■■■■■ 5.15
RALY-205ENST00000442805 SOGA1O94964 1423 aa47.2■■■■■ 5.15
RALY-205ENST00000442805 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.16■■■■■ 5.14
RALY-205ENST00000442805 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.07■■■■■ 5.13
RALY-205ENST00000442805 WDR97A6NE52 1622 aa47.05■■■■■ 5.12
RALY-205ENST00000442805 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.05■■■■■ 5.12
RALY-205ENST00000442805 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.05■■■■■ 5.12
RALY-205ENST00000442805 CUX1P39880 1505 aa46.95■■■■■ 5.11
RALY-205ENST00000442805 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.94■■■■■ 5.1
RALY-205ENST00000442805 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.9■■■■■ 5.1
RALY-205ENST00000442805 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.89■■■■■ 5.1
RALY-205ENST00000442805 SYNJ1O43426 1573 aa46.88■■■■■ 5.1
RALY-205ENST00000442805 GRIN2BQ13224 1484 aa46.84■■■■■ 5.09
RALY-205ENST00000442805 SYNJ2O15056 1496 aa46.75■■■■■ 5.07
RALY-205ENST00000442805 PBRM1Q86U86 1689 aa46.68■■■■■ 5.06
RALY-205ENST00000442805 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.62■■■■■ 5.05
RALY-205ENST00000442805 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.49■■■■■ 5.03
RALY-205ENST00000442805 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.49■■■■■ 5.03
RALY-205ENST00000442805 GRIN2AQ12879 1464 aa46.25■■■■■ 4.99
RALY-205ENST00000442805 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.2■■■■■ 4.99
RALY-205ENST00000442805 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.2■■■■■ 4.99
RALY-205ENST00000442805 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.18■■■■■ 4.98
RALY-205ENST00000442805 ADAMTS12P58397 1594 aa46.18■■■■■ 4.98
RALY-205ENST00000442805 CEP170Q5SW79 1584 aa46.12■■■■■ 4.97
RALY-205ENST00000442805 NUP160Q12769 1436 aa46.11■■■■■ 4.97
RALY-205ENST00000442805 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.09■■■■■ 4.97
RALY-205ENST00000442805 TOP2BQ02880 1626 aa46.07■■■■■ 4.97
RALY-205ENST00000442805 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP46.04■■■■■ 4.96
RALY-205ENST00000442805 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46■■■■■ 4.95
RALY-205ENST00000442805 SHROOM2Q13796 1616 aa45.98■■■■■ 4.95
RALY-205ENST00000442805 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.91■■■■■ 4.94
RALY-205ENST00000442805 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.7■■■■■ 4.91
RALY-205ENST00000442805 KIF13AQ9H1H9 1805 aa45.67■■■■■ 4.9
RALY-205ENST00000442805 JPH4Q96JJ6 628 aa45.62■■■■■ 4.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms