Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PROB1E7EW31 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PROB1E7EW31 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms