Protein–RNA interactions for Protein: A6NN73

GOLGA8CP, Golgin subfamily A member 8C, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8CPA6NN73 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8CPA6NN73 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA8CPA6NN73 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms